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7月28日

统计局:上半年城镇职工平均工资增18%

2008年07月28日10:48  新华网 
  新华网北京7月28日电 (周英峰 曾琴) 中国国家统计局28日发布的数据显示,今年
上半年,全国城镇单位在岗职工平均工资为12964元,比去年同期增长18.0%。

  国家统计局数据显示,今年上半年,城镇国有经济单位平均工资为13800元,同比增
长17.0%;城镇集体经济单位为7789元,增长18.9%;城镇其他经济类型单位为12610元,
增长19.2%。

  统计显示,2007年全年,全国城镇单位在岗职工平均工资为24932元。其中,2007年
上半年为10990元,同比增长18.5%。
 
啥世道啊,都没钱吃饭了,可怜俺这个处于低保线以下的穷光蛋。
7.28
7月27日

唉,睡不着了

刚跟jinzhili聊了大学的同学以及一些很8g的事,就睡不着了。
因为还聊了当时暗自喜欢的女生,哈哈。
仿如昨日,可惜早已远逝,跟他们成为同学,真是一生最幸福的事之一了。
挺想大家的。
不说了,不想了,且睡觉去。
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4月24日

学习雷锋好榜样

学习雷锋好榜样
    
洪  源词
生  茂曲

学习雷锋好榜样, 忠于革命忠于党,
爱憎分明不忘本, 立场坚定斗志强。

学习雷锋好榜样, 艰苦朴素永不忘,
愿做革命的螺丝钉, 集体主义思想放光芒。

学习雷锋好榜样, 毛主席的教导记心上,
全心全意为人民, 共产主义品德多高尚。

学习雷锋好榜样, 毛泽东思想来武装,
保卫祖国握紧枪, 努力学习天天向上。


小时候唱的很熟的歌曲,声声意犹在耳,很好听的歌曲阿。
以后要尽量多做好事,积攒人品,绝不跟女人搞暧昧,太puke了。
4月14日

这两天生病了。

不是很走运,希望最近能把代谢组学的的理论搞定,并把NMR的谱读好,马上做酵母的实验,上帝保佑一切顺利。
11月25日

蛋白质折叠

早在大约18个月以前就开始看了点蛋白质折叠方面的文章,那个时候是试图对它的动力学过程进行模拟,不过,由于蛋白质是生物大分子,如果用量子化学计算的精确方法进行模拟,那是不可能的事,而且蛋白质模拟过程中的势能函数也不精确,半经验的方法在解决实际问题中有很大的困难,所以也就放弃了蛋白质的动力学模拟,转而去搞小分子,如氨基酸,小肽等的从头算。最近,学习了生物大分子的有关课程,觉得蛋白质的折叠在我们的生命过程中尤其重要,尤其是现在很多疾病的产生跟蛋白质的错误折叠有关,著名的CELL杂志以及Annu. Rev.等一流的杂志等等都有很多关于蛋白质折叠的文章,现在把蛋白质折叠的一般知识摘录如下:
    一般来说,蛋白质的结构决定其功能(但是目前有些蛋白质没有结构却也有一定的功能,这种现象还在研究中),仅仅知道基因组序列并不能使我们充分了解蛋白质的功能,更无法知道它是如何工作的。蛋白质可凭借相互作用在细胞环境(特定的酸碱度、温度等)下自己组装自己,这种自我组装的过程被称为蛋白质折叠。
    蛋白质折叠问题被列为“21世纪的生物物理学”的重要课题,它是分子生物学中心法则尚未解决的一个重大生物学问题。从一级序列预测蛋白质分子的三级结构并进一步预测其功能,是极富挑战性的工作。研究蛋白质折叠,尤其是折叠早期过程,即新生肽段的折叠过程是全面的最终阐明中心法则的一个根本问题,在这一领域中,近年来的新发现对新生肽段能够自发进行折叠的传统概念做了根本的修正。这其中,X射线晶体衍射和各种波谱技术以及电子显微镜技术等发挥了极其重要的作用。第十三届国际生物物理大会(1999年,简称IUPAB,每三年举行一次)上,Nobel奖获得者Ernst在报告中强调指出,NMR用于研究蛋白质的一个主要优点在于它能极为详细的研究蛋白质分子的动力学,即动态的结构或结构的运动与蛋白质分子功能的关系。目前的NMR技术(虽然X射线晶体衍射在机械蛋白质结构方面有不少应用,但是其不能在液体环境下工作,不能模拟生理的条件进行实验研究,而且不能模拟动力学过程。)已经能够在秒到皮秒的时间域上观察蛋白质结构的运动过程,其中包括主链和侧链的运动,以及在各种不同的温度和压力下蛋白质的折叠和去折叠过程。蛋白质大分子的结构分析也不仅仅只是解出某个具体的结构,而是更加关注结构的涨落和运动。例如,运输小分子的酶和蛋白质通常存在着两种构象,结合配体的和未结合配体的。一种构象内的结构涨落是构象转变所必需的前奏,因此需要把光谱学,波谱学和X 射线结构分析结合起来研究结构涨落的平衡,构象改变和改变过程中形成的多种中间态,又如,为了了解蛋白质是如何折叠的,就必须知道折叠时几个基本过程的时间尺度和机制,包括二级结构(螺旋和折叠)的形成,卷曲,长程相互作用以及未折叠肽段的全面崩溃。多种技术用于研究次过程,如快速核磁共振,快速光谱技术(荧光,远紫外和近紫外圆二色)。
1蛋白质折叠研究的概况
    在生物体内,生物信息的流动可以分为两个部分:第一部分是存储于
DNA序列中的遗传信息通过转录和翻译传入蛋白质的一级序列中,这是一维信息之间的传递,三联子密码介导了这一传递过程;第二部分是肽链经过疏水塌缩、空间盘曲、侧链聚集等折叠过程形成蛋白质的天然构象,同时获得生物活性,从而将生命信息表达出来;而蛋白质作为生命信息的表达载体,它折叠所形成的特定空间结构是其具有生物学功能的基础,也就是说,这个一维信息向三维信息的转化过程是表现生命活力所必需的。
    自从20世纪60年代,Anfinsen基于还原变性的牛胰RNase在不需其他任何物质帮助下,仅通过去除变性剂和还原剂就使其恢复天然结构的实验结果,提出了“多肽链的氨基酸序列包含了形成其热力学上稳定的天然构象所必需的全部信息”的“自组装学说”以来,随着对蛋白质折叠研究的广泛开展,人们对蛋白质折叠理论有了进一步的补充和扩展。Anfinsen的“自组装热力学假说”得到了许多体外实验的证明,的确有许多蛋白在体外可进行可逆的变性和复性,尤其是一些小分子量的蛋白,但是并非所有的蛋白都如此。而且由于特殊的环境因素,体内蛋白质的折叠远非如此。
    体内蛋白质的折叠往往需要有其他辅助因子的参与,并伴随有ATP的水解。因此,Ellis 于1987年提出了蛋白质折叠的“辅助性组装学说”。这表明蛋白质的折叠不仅仅是一个
热力学的过程,显然也受到动力学的控制。有的学者基于有些相似氨基酸序列的蛋白质具有不同的折叠结构,而另外一些不同氨基酸序列的蛋白质在结构上却相似的现象,提出了mRNA二级结构可能作为一种遗传密码从而影响蛋白质结构的假说。但目前为止,该假说尚没有任何实验证据,只有一些纯数学论证[3]。那么,蛋白质的氨基酸序列究竟是如何确定其空间构象的呢?围绕这一问题科研人员已进行了大量出色的工作,但迄今为止我们对蛋白质的折叠机制的认识仍是不完整的,甚至有些方面还存在着错误的观点。
    在这方面作出重要贡献的典型研究实例是美国C.B.安芬森小组关于牛胰核糖核酸酶的变性和复性的研究。牛胰核糖核酸酶含有124个氨基酸残基,由8个巯基配对组成4对二硫键。可以计算出酶分子中8个巯基组成4对二硫键的可能方式有105种,这就提供了一个定量估算复性重组的指标。在温和的碱性条件下,8摩尔的浓脲和大量巯基乙醇能使四对二硫键完全还原,整个分子变为无规则卷曲状,酶分子变性。透析去除脲,在氧的存在下,二硫键重新形成,酶分子完全复性,二硫键中成对的巯基都与天然一样,复性分子可以结晶且具有与天然酶晶体相同的X射线衍射花样,从而证实,酶分子在复性过程中,不仅能自发地重新折叠,而且只选择了105种二硫键可能配对方式中的一种。
2蛋白质折叠机制的理论模型
     ▲框架模型(Framework Model)
     框架模型[4] 假设蛋白质的局部构象依赖于局部的氨基酸序列。在多肽链折叠过程的起始阶段, 先迅速形成不稳定的二级结构单元; 称为“flickering cluster”, 随后这些二级结构靠近接触, 从而形成稳定的二级结构框架;最后,二级结构框架相互拼接,肽链逐渐紧缩,形成了蛋白质的三级结构。这个模型认为即使是一个小分子的蛋白也可以一部分一部分的进行折叠, 其间形成的亚结构域是折叠中间体的重要结构。
    ▲疏水塌缩模型(Hydrophobic Collapse Model)
     在疏水塌缩模型[5]中,疏水作用力被认为是在蛋白质折叠过程中起决定性作用的力的因素。在形成任何二级结构和三级结构之前首先发生很快的非特异性的疏水塌缩。
    ▲扩散-碰撞-粘合机制 (Diffusion-Collision-Adhesion Model)
    该模型认为蛋白质的折叠起始于伸展肽链上的几个位点,在这些位点上生成不稳定的二级结构单元或者疏水簇,主要依靠局部序列的进程或中程(3-4个残基)相互作用来维系。它们以非特异性布朗运动的方式扩散、碰撞、相互黏附,导致大的结构生成并因此而增加了稳定性。进一步的碰撞形成具有疏水核心和二级结构的类熔球态中间体的球状结构。球形中间体调整为致密的、无活性的类似天然结构的高度有序熔球态结构。最后无活性的高度有序熔球态转变为完整的有活力的天然态。
    ▲成核-凝聚-生长模型(Nuclear-Condensation-Growth Model)
    根据这种模型,肽链中的某一区域可以形成“折叠晶核”,以它们为核心,整个肽链继续折叠进而获得天然构象。所谓“晶核”实际上是由一些特殊的氨基酸残基形成的类似于天然态相互作用的网络结构,这些残基间不是以非特异的疏水作用维系的,而是由特异的相互作用使这些残基形成了紧密堆积。晶核的形成是折叠起始阶段限速步骤。
    ▲拼版模型(Jig-Saw Puzzle Model)
    此模型[9]的中心思想就是多肽链可以沿多条不同的途径进行折叠, 在沿每条途径折叠的过程中都是天然结构越来越多, 最终都能形成天然构象, 而且沿每条途径的折叠速度都较快, 与单一途径折叠方式相比, 多肽链速度较快, 另一方面, 外界生理生化环境的微小变化或突变等因素可能会给单一折叠途径造成较大的影响,而对具有多条途径的折叠方式而言, 这些变化可能给某条折叠途径带来影响, 但不会影响另外的折叠途径, 因而不会从总体上干扰多肽链的折叠, 除非这些因素造成的变化太大以致于从根本上影响多肽链的折叠。
分子伴侣
    1978 年,Laskey 在进行组蛋白和DNA 在体外生理离子强度实验时发现,必须要有一种细胞核内的酸性蛋白———核质素(nucleoplasmin) 存在时,二者才能组装成核小体,否则就发生沉淀。据此Laskey 称它为“分子伴侣”。分子伴侣是指能够结合和稳定另外一种蛋白质的不稳定构象,并能通过有控制的结合和释放,促进新生多肽链的折叠、多聚体的装配或降解及细胞器蛋白的跨膜运输的一类蛋白质 [10,11] 。分子伴侣是从功能上定义的,凡具有这种功能的蛋白质都是分子伴侣,它们的结构可以完全不同。这一概念目前已延伸到许多蛋白质,现已鉴定出来的分子伴侣主要属于三类高度保守的蛋白质家族[12]:stress 90 family、stress 70 family、stress 60 family。其中stress 60 family存在于真核生物的线粒体(在哺乳动物中称为Hsp58)、叶绿体(称为cpn60)中,在原核生物的细胞质中,它被称为GroEL。
意义和前景
    蛋白质折叠机制的阐明将揭示生命体内的第二套
遗传密码,这是它的理论意义。蛋白质折叠的研究,比较狭义的定义就是研究蛋白质特定三维空间结构形成的规律、稳定性和与其生物活性的关系。在概念上有热力学的问题和动力学的问题;蛋白质在体外折叠和在细胞内折叠的问题;有理论研究和实验研究的问题。这里最根本的科学问题就是多肽链的一级结构到底如何决定它的空间结构?既然前者决定后者,一级结构和空间结构之间肯定存在某种确定的关系,这是否也像核苷酸通过“三联密码”决定氨基酸顺序那样有一套密码呢?有人把这设想的一级结构决定空间结构的密码叫作“第二遗传密码”。
  如果说“
三联密码”已被破译而实际上已成为明码,那么破译“第二遗传密码”正是“蛋白质结构预测”从理论上最直接地去解决蛋白质的折叠问题,这是蛋白质研究最后几个尚未揭示的奥秘之一。“蛋白质结构预测”属于理论方面的热力学问题。就是根据测得的蛋白质的一级序列预测由Anfinsen原理决定的特定的空间结构。蛋白质氨基酸序列,特别是编码蛋白质的核苷酸序列的测定现在几乎已经成为常规技术,从互补DNA(cDNA)序列可以根据“三联密码”推定氨基酸序列,这些在上一世纪获得重大突破的分子生物学技术,大大加速了蛋白质一级结构的测定。目前蛋白质数据库中已经存有大约17万个蛋白的一级结构,但是测定了空间结构的蛋白大约只有1.2万个,这中间有许多是很相似的同源蛋白,而真正不同的蛋白只有1000多个。随着人类基因组计划的胜利完成,解读了人类DNA的全序列,蛋白质一级结构的数据增长必定会出现爆炸的态势,而空间结构测定的速度远远滞后,因此二者之间还会形成更大的距离,这就更需要进行蛋白质结构的预测。
    同时,它还存在重要的潜在应用前景,例如以下几个方面:
    ▲利用
DNA重组技术可以将外源基因导入宿主细胞。但重组基因的表达产物往往形成无活性的、不溶解的包涵体。折叠机制的阐明对包涵体的性会有重要帮助。
    ▲DNA重组和多肽合成技术的发展使我们能够按照自己的意愿设计较长的多肽链。但由于我们无法了解这一多肽将折叠为何种构象,从而无法按照自己意愿设计我们需要的、具有特定功能的蛋白质。
    ▲许多疾病,如
阿兹海默症(Alzheimer's),疯牛病(Mad Cow, BSE),可传播性海绵状脑病(CJD),肌萎缩性脊髓侧索硬化症(ALS),还有帕金森氏症(Parkinson's)等正是由于一些细胞内的重要蛋白发生突变,导致蛋白质聚沉或错误折叠而造成的。因此,深入了解蛋白质折叠与错误折叠的关系对于这些疾病的致病机制的阐明以及治疗方法的寻找将大有帮助。
    ▲基因组序列的发展使我们得到了大量的蛋白质序列,结构信息的获得对于揭示它们的生物学功能是十分重要的。依靠现有手段(X-ray晶体衍射、
NMR电镜)测定蛋白质的结构需要较长的时间,因此结构解析的步伐已落后于发现新蛋白的步伐。而结构预测的方法虽然速度较快,但可靠性并不高,只有当我们对于维持蛋白质结构,驱动蛋白质折叠的理化因素更为了解,这一方法才可能有根本的改进。另外,我们对于蛋白质相互作用、配体与蛋白质的作用等结构与功能关系的研究也有赖于蛋白质折叠机制的阐明。
蛋白质折叠与“折叠病” 】 
    人们对由于基因突变造成蛋白质分子中仅仅一个氨基酸残基的变化就引起疾病的情况已有所了解,即所谓“分子病”,如地中海镰刀状红血球贫血症就是因为血红蛋白分子中第六位的谷氨酸突变成了颉氨酸。现在则发现蛋白质分子的氨基酸序列没有改变,只是其结构或者说构象有所改变也能引起疾病,那就是所谓“构象病”,或称“折叠病”。 
    大家都知道的疯牛病,它是由一种称为Prion的蛋白质的感染引起的,这种蛋白质也可以感染人而引起神经系统疾病。在正常机体中,Prion是正常神经活动所需要的蛋白质,而致病Prion与正常Prion的一级结构完全相同,只是空间结构不同。这一疾病的研究涉及到许多生物学的基本问题。一级结构完全相同的蛋白质为什么会有不同的空间结构,这与Anfinsen原理是否矛盾?显然这里有蛋白质的能量和稳定性问题。 
    从来认为蛋白结构的变化来自于序列的变化,而序列的变化来自于基因的变化,生命信息从核酸传递到蛋白。而致病Prion的信息已被诺贝尔奖获得者普鲁辛纳证明不是来自基因的变化,致病蛋白Prion导致正常蛋白Prion转变为致病的折叠状态是通过蛋白分子间的作用而感染!这种相互作用的本质和机制是什么?仅仅改变了折叠状态的分子又如何导致严重的疾病?这些问题都不能用传统的概念给予满意的解释,因此在科学界引起激烈的争论,有关研究的强度和竞争性也随之大大增强。 
     由于蛋白质折叠异常而造成分子聚集甚至沉淀或不能正常转运到位所引起的疾病还有老年性痴呆症、囊性纤维病变、家族性高胆固醇症、家族性淀粉样蛋白症、某些肿瘤、
白内障等等。由于分子伴侣在蛋白质折叠中至关重要的作用,分子伴侣本身的突变显然会引起蛋白质折叠异常而引起折叠病。随着蛋白质折叠研究的深入,人们会发现更多疾病的真正病因和更针对性的治疗方法,设计更有效的药物。现在发现有些小分子可以穿越细胞作为配体与突变蛋白结合,从而使原已失去作战能力的突变蛋白逃逸“蛋白质质量控制系统”而“带伤作战”。这种小分子被称为“药物分子伴侣”,有希望成为治疗“折叠病”的新药。 新生肽的折叠问题或蛋白质折叠问题不仅具有重大的科学意义,除了上面提到的在医学上的应用价值外,在生物工程上具有极大的应用价值。基因工程和蛋白工程已经逐渐发展成为产值以数十亿美元计的大产业,进入21世纪后,还将会有更大的发展。但是当前经常遇到的困难,是在简单的微生物细胞内引入异体DNA后所合成的多肽链往往不能正确折叠成为有生物活性的蛋白质而形成不溶解的包含体或被降解。这一“瓶颈”问题的彻底解决有待于对新生肽链折叠更多的认识。
 
图片来自于 Annu. Rev. Biochem. 2001. 70:603–47里的插图,
Annu. Rev. Biochem..JPG
8月6日

第二次握手

简介 ······

  1956年秋,药物研究所苏冠兰教授家,来了一个华侨打扮的不速女客。教授夫人叶玉菡热情迎接这位不相识的客人;但苏教授却显得又惊愕又痛苦。来客望了望两位主人,什么也没有讲,就匆匆离去。原来,早在1928年,苏冠兰在齐鲁大学读书,暑假去江南度假。一次,他奋不顾身地跳江救了一个落水的姑娘丁洁琼。科学救国的共同志向使他俩产生了爱情。在南京火车站,他俩握手告别,并立下海誓山盟。苏冠兰的父亲苏凤琪,执意迫使儿子与故友的女儿叶玉菡成婚,苏冠兰无奈,只得以"20年后结婚"为借口推迟婚期,不料叶玉菡竟然接受了这个条件。苏冠兰为了摆脱父亲的束缚,准备与丁洁琼一起赴美留学。谁料齐鲁大学校长、美国联邦调查局的特务查路德从中作梗,迫使丁洁琼只身赴美。丁在美国学者奥姆霍斯指导和帮助下获得了博士学位,后因反对美国在广岛使用原子弹,被美监禁,从此中断了与苏冠章的联系。这时,苏冠兰的父亲骗儿子说,丁洁琼已与奥姆霍斯结婚,使苏冠兰痛苦万分。在苏冠兰与美国特务搏斗时,叶玉菡用身子挡住了射向苏冠兰的子弹,苏冠兰深受感动,便与叶玉菡结为夫妻。丁洁琼始终铭记与苏冠兰的誓言,拒绝了奥姆霍斯对她的真诚爱情,毅然回到祖国。当她满怀希望地找到苏冠兰时,才知道苏冠兰已与叶玉菡结婚。丁洁琼怀着深深的痛苦,离开了苏冠兰的家,决定到遥远的边疆去搞科研工作。在周总理的关怀和科学界友人的劝慰中,在苏冠兰、叶玉菡热诚挽留下,丁洁琼抛开了个人的不幸,终于振作精神,第二次和他握起手来。

作者简介 ······

  1944年5月生于河南长葛,在湖南长沙长大。1961年10月发表处女作。1963年2月,写下短篇小说《浪花》,以后历次重写,1970年稿更名为《归来》,并以手抄本形式流传全国。在流传过程中,改名为《第二次握手》。张扬现为湖南省作家协会专业作家、副主席。
丁洁琼,女神的化身.
7月4日

做了个心理测试。

从age的blog上看到的,试了试,还是挺好玩的,结果贴到下面。
你的心理年龄(psychological age) 32
你的成熟度是 128%, 你的心理处在成年时期。你成熟、稳健、老练、实际,能够合情合理地处理现实人生、理想的种种矛盾,比较理智地看待完美与缺陷,获得与丧失。清楚地认识自己,能清明地分辨可能与不能,可为与不可为。但这种状态稍有偏失,你就会走进保守与停滞,也容易导致的将是创造性和人生乐趣的丧失。
发现跟我不符合啊,郁闷了。
6月19日

端午节(摘自百度)

端午节简介

        农历五月初五,是中国民间的传统节日——端午节(the Dragon-Boat Festival),也叫“端阳”、“蒲节”、“天中节”、“大长节”、“沐兰节”、“女儿节”、“小儿节”。它是汉族的传统节日之一。端午也称端五,端阳。此外,端午节还有许多别称,如:午日节、重五节,五月节、浴兰节、女儿节,天中节、地腊、诗人节、龙日、艾节、端五、夏节等等。虽然名称不同,但总体上说,各地人民过节的习俗还是同多于异的。 时至今日,端午节仍是中国人民中一个十分盛行的隆重节日。
        端午节是全年四大节之一。五月是毒月,五日是毒日,五日的中午又是毒时,居三毒之端。端午节又叫“五月端”。五月是整个热天的开端,五毒蛇开始活跃,鬼魅魍魉也会猖獗,这些都会给人特别是会给无所顾忌又无抵抗能力的孩子带来灾难,必须在五月端这天集中地为孩子消灾防毒,因此,人们又把五月端午节说成是“小孩节”或“娃娃节”。
        过端午节,是中国人二千多年来的传统习惯,由于地域广大,民族众多,部分蒙古、壮、布依、朝鲜、侗、瑶、白、土家、哈尼、畲、拉祜、水、纳西族达斡尔、仫佬、羌、仡佬、锡伯族、普米、鄂温克、裕固、鄂伦春等少数民族也过此节,加上许多故事传说,于是不仅产生了众多相异的节名,而且各地也有着不尽相同的习俗。其内容主要有:女儿回娘家,挂钟馗像,迎鬼船、躲午,帖午叶符,悬挂菖蒲艾草,游百病,佩香囊,备牲醴,赛龙舟,比武,击球,荡秋千,给小孩涂雄黄,饮用雄黄酒菖蒲酒,吃五毒饼咸蛋粽子和时令鲜果等,除了有迷信色彩的活动渐已消失外,其余至今流传中国各地及邻近诸国。有些活动,如赛龙舟等,已得到新的发展,突破了时间、地域界线,成为了国际性的体育赛事。

端午节由来

        关于端午节的由来,说法甚多,诸如:纪念屈原说;纪念伍子胥说 ;纪念曹娥说;起于三代夏至节说;恶月恶日驱避说,吴月民族图腾祭说等等。以上各说,各本其源。据学者闻一多先生的《端午考》和《端午的历史教育》列举的百余条古籍记载及专家考古考证,端午的起源,是中国古代南方吴越民族举行图腾祭的节日,比屈原更早。但千百年来,屈原的爱国精神和感人诗辞,已广泛深入人心,故人们“惜而哀之,世论其辞,以相传焉”,因此,纪念屈原之说,影响最广最深,占据主流地位。在民俗文化领域,中国民众把端午节的龙舟竞渡和吃粽子等,都与纪念屈原联系在一起。
        端午节是古老的传统节日,始于中国的春秋战国时期,至今已有2000多年历史。端午节的由来与传说很多,这里仅介绍以下四种:

        1、源于纪念屈原
        据《史记》“屈原贾生列传”记载,屈原,是战国时期楚怀王的大臣。他倡导举贤授能,富国强兵,力主联齐抗秦,遭到贵族子兰等人的强烈反对,屈原遭馋去职,被赶出都城,流放到沅、湘流域。他在流放中,写下了忧国忧民的《离骚》、《天问》、《九歌》等不朽诗篇,独具风貌,影响深远(因而,端午节也称诗人节)。公元前278年,秦军攻破楚国京都。屈原眼看自己的祖国被侵略,心如刀割,但是始终不忍舍弃自己的祖国,于五月五日,在写下了绝笔作《怀沙》之后,抱石投汨罗江身死,以自己的生命谱写了一曲壮丽的爱国主义乐章。
        传说屈原死后,楚国百姓哀痛异常,纷纷涌到汨罗江边去凭吊屈原。渔夫们划起船只,在江上来回打捞他的真身。有位渔夫拿出为屈原准备的饭团、鸡蛋等食物,“扑通、扑通”地丢进江里,说是让鱼龙虾蟹吃饱了,就不会去咬屈大夫的身体了。人们见后纷纷仿效。一位老医师则拿来一坛雄黄酒倒进江里,说是要药晕蛟龙水兽,以免伤害屈大夫。后来为怕饭团为蛟龙所食,人们想出用楝树叶包饭,外缠彩丝,发展成棕子。
        以后,在每年的五月初五,就有了龙舟竞渡、吃粽子、喝雄黄酒的风俗;以此来纪念爱国诗人屈原。

        2、源于纪念伍子胥
        端午节的第二个传说,在江浙一带流传很广,是纪念春秋时期(公元前770--前476年)的伍子胥。伍子胥名员,楚国人,父兄均为楚王所杀,后来子胥弃暗投明,奔向吴国,助吴伐楚,五战而入楚都郢城。当时楚平王已死,子胥掘墓鞭尸三百,以报杀父兄之仇。吴王阖庐死后,其子夫差继位,吴军士气高昂,百战百胜,越国大败,越王勾践请和,夫差许之。子胥建议,应彻底消灭越国夫差不听,吴国大宰,受越国贿赂,谗言陷害子胥,夫差信之,赐子胥宝剑,子胥以此死。子胥本为忠良,视死如归,在死前对邻舍人说:“我死后,将我眼睛挖出悬挂在吴京之东门上,以看越国军队入城灭吴”,便自刎而死,夫差闻言大怒,令取子胥之尸体装在皮革里于五月五日投入大江,因此相传端午节亦为纪念伍子胥之日。

        3、源于纪念孝女曹娥
        端午节的第三个传说,是为纪念东汉(公元23--220年)孝女曹娥救父投江。曹娥是东汉上虞人,父亲溺于江中,数日不见尸体,当时孝女曹娥年仅十四岁,昼夜沿江号哭。过了十七天,在五月五日也投江,五日后抱出父尸。就此传为神话,继而相传至县府知事,令度尚为之立碑,让他的弟子邯郸淳作诔辞颂扬。
        孝女曹娥之墓,在今浙江绍兴,后传曹娥碑为晋王义所书。后人为纪念曹娥的孝节,在曹娥投江之处兴建曹娥庙,她所居住的村镇改名为曹娥镇,曹娥殉父之处定名为曹娥江。

        4、源于古越民族图腾祭
        近代大量出土文物和考古研究证实:长江中下游广大地区,在新石器时代,有一种几何印纹陶为特征的文化遗存。该遗存的族属,据专家推断是一个崇拜龙的图腾的部族----史称百越族。出土陶器上的纹饰和历史传说示明,他们有断发纹身的习俗,生活于水乡,自比是龙的子孙。其生产工具,大量的还是石器,也有铲、凿等小件的青铜器。作为生活用品的坛坛罐罐中,烧煮食物的印纹陶鼎是他们所特有的,是他们族群的标志之一。直到秦汉时代尚有百越人,端午节就是他们创立用于祭祖的节日。在数千年的历史发展中,大部分百越人已经融合到汉族中去了,其余部分则演变为南方许多少数民族,因此,端午节成了全中华民族的节日。

端午节习俗

        我国民间过端午节是较为隆重的,庆祝的活动也很丰富,从早晨天蒙蒙亮开始,一直持续到正午才结束。比较普遍的活动有以下种种形式:

        1、赛龙舟
        赛龙舟,是端午节的主要习俗。相传起源于古时楚国人因舍不得贤臣屈原投江死去,许多人划船追赶拯救。他们争先恐后,追至洞庭湖时不见踪迹。之后每年五月五日划龙舟以纪念之。借划龙舟驱散江中之鱼,以免鱼吃掉屈原的身体。竞渡之习,盛行于吴、越、楚。
        其实 ,“龙舟竞渡”早在战国时代就有了。在急鼓声中划刻成龙形的独木舟,做竞渡游戏,以娱神与乐人,是祭仪中半宗教性、半娱乐性的节目。
        后来,赛龙舟除纪念屈原之外,在各地人们还付予了不同的寓意。
        江浙地区划龙舟,兼有纪念当地出生的近代女民主革命家秋瑾的意义。夜龙船上,张灯结彩,来往穿梭,水上水下,情景动人,别具情趣。贵州苗族人民在农历五月二十五至二十八举行“龙船节”,以庆祝插秧胜利和预祝五谷丰登。云南傣族同胞则在泼水节赛龙舟,纪念古代英雄岩红窝。不同民族、不同地区,划龙舟的传说有所不同。直到今天在南方的不少临江河湖海的地区,每年端节都要举行富有自己特色的龙舟竞赛活动。
        清乾隆二十九年(1736年),台湾开始举行龙舟竞渡。当时台湾知府蒋元君曾在台南市法华寺半月池主持友谊赛。现在台湾每年五月五日都举行龙舟竞赛。在香港,也举行竞渡。
        此外,划龙舟也先后传入邻国日本、越南等及英国。1980年,赛龙舟被列入中国国家体育比赛项目,并每年举行“屈原杯”龙舟赛。1991年6月16日(农历五月初五),在屈原的第二故乡中国湖南岳阳市,举行首届国际龙舟节。在竞渡前,举行了既保存传统仪式又注入新的现代因素的“龙头祭”。 “龙头”被抬入屈子祠内,由运动员给龙头“上红”(披红带)后,主祭人宣读祭文,并为龙头“开光”(即点晴)。然后,参加祭龙的全体人员三鞠躬,龙头即被抬去汩罗江,奔向龙舟赛场。此次参加比赛、交易会和联欢活动的多达60余万人,可谓盛况空前。尔后,湖南便定期举办国际龙舟节。赛龙舟将盛传于世。

        2、端午食粽
        端午节吃粽子,这是中国人民的又一传统习俗。粽子,又叫“角黍”、“筒粽”。其由来已久,花样繁多。
        据记载,早在春秋时期,用菰叶(茭白叶)包黍米成牛角状,称“角黍”;用竹筒装米密封烤熟,称“筒粽”。东汉末年,以草木灰水浸泡黍米,因水中含碱,用菰叶包黍米成四角形,煮熟,成为广东碱水粽。
        晋代,粽子被正式定为端午节食品。这时,包粽子的原料除糯米外,还添加中药益智仁,煮熟的粽子称“益智粽”。 时人周处《岳阳风土记》记载:“俗以菰叶裹黍米,……煮之,合烂熟,于五月五日至夏至啖之,一名粽,一名黍。”南北朝时期,出现杂粽。米中掺杂禽兽肉、板栗、红枣、赤豆等,品种增多。粽子还用作交往的礼品。
        到了唐代,粽子的用米,已“白莹如玉”,其形状出现锥形、菱形。日本文献中就记载有“大唐粽子”。宋朝时,已有“蜜饯粽”,即果品入粽。诗人苏东坡有“时于粽里见杨梅”的诗句。这时还出现用粽子堆成楼台亭阁、木车牛马作的广告,说明宋代吃粽子已很时尚。元、明时期,粽子的包裹料已从菰叶变革为箬叶,后来又出现用芦苇叶包的粽子,附加料已出现豆沙、猪肉、松子仁、枣子、胡桃等等,品种更加丰富多彩。
        端午节的早晨家家吃粽子纪念屈原,一般是前一天把粽子包好,夜间煮熟,早晨食用。包粽子主要是用河塘边盛产的嫩芦苇叶,也有用竹叶的,统称粽叶。粽子的传统形式为三角形,一般根据内瓤命名,包糯米的叫米粽,米中掺小豆的叫小豆粽,掺红枣的叫枣粽;枣粽谐音为“早中”,所以吃枣粽的最多,意在读书的孩子吃了可以早中状元。过去读书人参加科举考试的当天,早晨都要吃枣粽,至今中学、大学入学考试日的早晨,家长亦要做枣粽给考生吃。
        煮粽子的锅里一定要煮鸡蛋,有条件的还要再煮些鸭蛋、鹅蛋,吃过蘸糖的甜粽之后,要再吃蘸盐的鸡蛋“压顶”。据说吃五月端粽锅里的煮鸡蛋主夏天不生疮;把粽子锅里煮的鸭蛋、鹅蛋放在正午时阳光下晒一会再吃,整个夏天不头痛。
        一直到今天,每年五月初,中国百姓家家都要浸糯米、洗粽叶、包粽子,其花色品种更为繁多。从馅料看,北方多包小枣的北京枣粽;南方则有豆沙、鲜肉、火腿、蛋黄等多种馅料,其中以浙江嘉兴粽子为代表。吃粽子的风俗,千百年来,在中国盛行不衰,而且流传到朝鲜、日本及东南亚诸国。

        3、佩香囊
        端午节小孩佩香囊,传说有避邪驱瘟之意,实际是用于襟头点缀装饰。香囊内有朱砂、雄黄、香药,外包以丝布,清香四溢,再以五色丝线弦扣成索,作各种不同形状,结成一串,形形色色,玲珑可爱。★在中国某些南方城市,青年男女还用香囊来表达爱意。

        4、悬艾叶菖蒲
        民谚说:“清明插柳,端午插艾”。在端午节,人们把插艾和菖蒲作为重要内容之一。家家都洒扫庭除,以菖蒲、艾条插于门眉,悬于堂中。并用菖蒲、艾叶、榴花、蒜头、龙船花,制成人形或虎形,称为艾人、艾虎;制成花环、佩饰,美丽芬芳,妇人争相佩戴,用以驱瘴。
        艾,又名家艾、艾蒿。它的茎、叶都含有挥发性芳香油。它所产生的奇特芳香,可驱蚊蝇、虫蚁,净化空气。中医学上以艾入药,有理气血、暖子宫、祛寒湿的功能。将艾叶加工成“艾绒”,是灸法治病的重要药材。
        菖蒲是多年生水生草本植物,它狭长的叶片也含有挥发性芳香油,是提神通窍、健骨消滞、杀虫灭菌的药物。
        可见,古人插艾和菖蒲是有一定防病作用的。端午节也是自古相传的“卫生节”,人们在这一天洒扫庭院,挂艾枝,悬菖蒲,洒雄黄水,饮雄黄酒,激浊除腐,杀菌防病。这些活动也反映了中华民族的优良传统。端午节上山采药,则是我国各国个民族共同的习俗。

        5、悬钟馗像
        钟馗捉鬼,是端午节习俗。在江淮地区,家家都悬钟馗像,用以镇宅驱邪。唐明皇开元,自骊山讲武回宫,疟疾大发,梦见二鬼,一大一小,小鬼穿大红无裆裤,偷杨贵妃之香囊和明皇的玉笛,绕殿而跑。大鬼则穿蓝袍戴帽,捉住小鬼,挖掉其眼睛,一口吞下。明皇喝问,大鬼奏曰:臣姓钟馗,即武举不第,愿为陛下除妖魔,明皇醒后,疟疾痊愈,于是令画工吴道子,照梦中所见画成钟馗捉鬼之画像,通令天下于端午时,一律张贴,以驱邪魔。

        6、挂荷包和拴五色丝线
        应劭《风俗通》记载:“五月五日,以五彩丝系臂,名长命缕,一名续命缕,一命辟兵缯,一名五色缕,一名朱索,辟兵及鬼,命人不病瘟”。
        中国古代崇拜五色,以五色为吉祥色。因而,节日清晨,各家大人起床后第一件大事便是在孩子手腕、脚腕、脖子上拴五色线。系线时,禁忌儿童开口说话。五色线不可任意折断或丢弃,只能在夏季第一场大雨或第一次洗澡时,抛到河里。据说,戴五色线的儿童可以避开蛇蝎类毒虫的伤害;扔到河里,意味着让河水将瘟疫、疾病冲走,儿童由此可以保安康。
        孟元老的《东京梦华录》卷八记载:端午节物,百索、艾花、银样鼓儿,花花巧画扇,香糖果子、粽小,白团。紫苏、菖蒲、木瓜、并皆茸切,以香药相和,用梅红匣子盛裹。自五月一日及端午前一日,卖桃、柳、葵花、蒲叶、佛道艾。次日家家铺陈于门首,与五色水团、茶酒供养。又钉艾人于门上,士庶递相宴赏。
        陈示靓的《岁时广记》引《岁时杂记》提及一种“端五以赤白彩造如囊,以彩线贯之,搐使如花形,或带或钉门上,以禳赤口白舌,又谓之搐钱”。以及另一种“蚌粉铃”:“端五日以蚌粉纳帛中,缀之以绵,若数珠。令小儿带之以吸汗也。”这些随身携带的袋囊内容物几经变化,从吸汗的蚌粉、驱邪的灵符、铜钱,辟虫的雄黄粉,发展成装有香料的香囊,制作也日趋精致,成为端午节特有的民间艺品。
        类似还有饮雄黄酒:此种习俗,在长江流域地区的人家很盛行。游百病:此种习俗,盛行于贵州地区的端午习俗。

端午节诗选

        1、端午
             (唐)文秀

        节分端午自谁言,万古传闻为屈原;
        堪笑楚江空渺渺,不能洗得直臣冤。

        2、七律·端午
             (唐)殷尧藩

        少年佳节倍多情,老去谁知感慨生;
        不效艾符趋习俗,但祈蒲酒话升平。
        鬓丝日日添白头,榴锦年年照眼明;
        千载贤愚同瞬息,几人湮没几垂名。

        3、竞渡歌(节录)
             (唐)张建封

        五月五日天晴明,杨花绕江啼晓鹰;
        使君未出郡斋外,江上早闻齐和声;
        使君出时皆有准,马前已被红旗引;
        两岸罗衣扑鼻香,银钗照日如霜刃;
        鼓声三下红旗开,两龙跃出浮水来;
        棹影斡波飞万剑,鼓声劈浪鸣千雷;
        鼓声渐急标将近,两龙望标目如瞬;
        坡上人呼霹雳惊,竿头彩挂虹霓晕;
        前船抢水已得标,后船失势空挥挠。

        4、节令门·端阳
             (清)李静山

        樱桃桑椹与菖蒲,更买雄黄酒一壶。
        门外高悬黄纸帖,却疑账主怕灵符。

        5、七律.端午
              老 舍

        端午偏逢风雨狂,村童仍着旧衣裳;
        相邀情重携蓑笠,敢为泥深恋草堂;
        有客同心当骨肉,无钱买酒卖文章;
        当年此会鱼三尺,不似今朝豆味香。

端午节对联

        1、千载招魂悲楚仕
           万人抚卷叹离骚

        2、去秽除邪,千户门前悬虎艾
           尊贤吊古,万人江岸喝龙舟

        3、汨罗沉没一流恨
           湘楚长怀千古羞  

        4、难得钟情 两遭流放离骚赋
         惟怀义胆 一佐报国厄运横
  
      5、义报祖国 放逐难泯诗人志
         魂牵桑梓 情爱唯倾荆楚山  

        6、包粽子,举国欢宴聚亲友,
         赛龙舟,把酒吟诗慰圣贤
        7、我为他哭屈落水
         他为我辈壮升天  
  
        8、不畏汨罗河水深
         甘冒东海浪涛激  
  
        9、时逢端午思屈子
           每见龙舟想汩罗  

        10、应悬虎艾赛龙舟吃粽子
            莫赋闲诗撒怨气叹屈公  

        11、报国遭谗两放逐,痴心不改九章出。
          汨罗滚滚万人泪,惟有离骚千古流。  

        12、念故人,万户千家包粽子
          庆佳节,敲锣打鼓赛龙舟

        13、芳草美人屈子赋
          冰心洁玉大夫诗  

        14、赛龙夺锦 鼓声催发健儿奋;
            端日弄波 浆拍浩汤舟队威。  
   
   
        15、箬叶飘香,一粽尝来千古事;
            龙舟逐水,百桡划出四时情。
5月14日

中国科大收到建校以来最大单笔捐款用于奖助学(zz)

中新网5月14日电 中国青年报消息,记者从中国科技大学获悉,中国科学院已经正式决
定设立“中国科学院科大教育基金”,将捐资1亿元重点用于奖励和资助中国科技大学的
优秀学生和贫困生学习以及在教书育人中作出突出贡献的教职员工。 
   报道称,中科院国有资产经营有限责任公司将捐资1亿元人民币设立此项基金,这是
中国科技大学建校以来收到的最大的单笔捐助。基金初始本金为1亿元人民币,本金的运
营收益用于奖励和资助,每年进行一次。基金主要用于3个方面,一是设立奖学金,奖励
品学兼优的各类创新型人才,培养全面发展的高素质英才;二是设立助学项目,帮助贫
困学生顺利完成学业,实现教育的社会公平;三是设立奖教金,奖励在教书育人中作出
突出贡献的教职员工。
  据悉,“中国科学院科大教育基金”设立后,中国科大的学生获得奖励和资助的面
和力度将大幅提升。
但愿这笔款能得到合理得安排,希望科大更好。
5月12日

DFT方法和HF方法的比较。

计算中非常常用的方法。DFT方法考虑了电子相关,而且算起来也快,所以很多人喜欢用,其中又以B3LYP最为常用,所以清楚每种方法的优劣和适用范围有利于我们对问题的理解。
  HF
方法忽略的大部分的电子相关。相反,在很多时候DFT方法常常是过多的考虑了电子相关,这会使得过渡态的能量偏低,造成算出来的活化能偏低而且计算氢键的键能也会偏低。
  
并且在计算有机分子的芳香性也不好,DFT会过多考虑电子离域,导致计算出来的能量偏低
  
但对于过渡金属、有机生物分子,DFT方法都能很好的处理,这是它比其它方法好的地方。
  
由于HF方法忽略了电子相关,所以在处理弱键的时候是不好的,所以我们一般也不用它来计算活化能(偏高)和解离能(偏低)并且在体系中如果有孤对电子、共扼体系的话,电子比较松散或者离域的比较厉害,这时候电子相关也很重要,HF方法也不能很好的定量解决。
   B3LYP
与其它泛函相比,对分子基态得到的特性一般相差不大。所以B3LYP很常用也无可厚非。
  
但是一些人用TDDFT算激发能也用B3LYP,而且只用B3LYP,很差的结果也拿出来发表,根本不考虑原因,这就有问题了。上个世纪末,很多使用TDDFT算激发能的文章都得到一个相同的结论,就是B3LYPTDDFT激发能计算的结果是不可靠的:对不同的分子体系,有的时候跟实验值相当接近,有的时候却差得不得了。因此在做TDDFT激发能计算的时候,应该多试几种泛函,特别是没有实验值,或者B3LYP的结果比较差的时候。如果图省事,想找一个通用的泛函作TDDFT计算,推荐用PBE极其几种改进版,Gaussian 98的用户可以用B3PW91。它们比较稳定,虽然不总是最好,但也不会太差。另外,HCTH系列泛函(特别是HCTH407)也值得一试。 
   B3LYP
之所以计算TS能量会偏低,主要在于其交换相关势不够准确,特别是在长程区的渐近行为不够好,也正是如此,b3lyp是不可能准确计算氢键.上次徐昕老师在作报告时就提到了b3lyp在计算氢键和van der wal力结果是poor and bad,他发展的 X3LYP是可以得到较好的结果的.B3LYP计算弱相互作用体系He2是不成键的,X3LYP计算是成键的,所以X3LYP在远程势的渐近行为是比较好的,如果用来计算过渡态的话也比b3lyp要准确的多.当然,现在出现了很多的泛函结果都会比b3lyp准确,不过要加入程序还尚待时日,希望大家在计算前要仔细考虑所用的方法合不合适.

Gaussian寻找过渡态经验小结

寻找过渡态不是一件容易的事(对于我和大多数刚涉及量化的人来说),下面写写过程。
   1.
首先遇到的问题是,用哪种方法来寻找过渡态?
   GAUSSIAN
提供的方法是QSTNTSN方法。两种方法各有优点和缺点。QSTN方法特别QST3方法要求输入反应物,过渡态的猜测结构,产物这三者的结构。特别麻烦。但很管用,一般不会出现不收敛的情况。对于TSN(对应关键词为OPT=TS)方法,只要求输入过渡态的初始结构,但这个初始结构非常的关键,如果结构不好,则很容易出现不收敛的情况。建议如果是刚开始做过度态的话,用QSTN方法是好的选择,等有了感觉之后,再用TSN方法。
   2.
怎么解决经常出现的错误?
   
在找过度态的时候,经常碰到的一些问题就是(1)不收敛,(2)有一个错误的本征值(错误信息为:there is a wrong sign eigenvalue in hessian matrix.....),(3)和LINK9999错误导致退出。对于不收敛的情况,可以分为两类,比如提示信息里的CONVERGENCE FAILER 提醒收敛到了10-5),而此时你设定的SCF循环次数也仅仅是64步,那么完全有希望通过加大SCF循环次数来达到收敛的目的。倘若只收敛到10-3)或10-2),此时加大循环次数可能就没用了。结果还是CONVERGE FAILER 此时可采用SCF=QC,来达到强制收敛的目的 。因为SCF=QCLINK508)的计算量比默认的L502要大,所以不到万不得以就不用它了。出现第二个错误可以直接用 关键词OPT=NOEIGEN 来实现。LINK9999出错是因为已经走完了默认的步数,但还未完成。系统会自动跳出。出现这种情况大多数就是因为优化步数和SCF步数超过了默认值。可用OPTMAXCYCLE=100)和SCFMAXCYCLE=300)来改错。
   3.
怎么样控制过渡态的优化,使得过渡态不至于收敛到其他的分子结构中去?
   
GAUSS VIEW 可以解决这个问题 ,当刚开始运行GAUSSIAN时,用GVIEW去打开输出文件时,可以看到你的过渡态的初始输入结构,当一个循环过后(从上一个LINK502到下一个LINK502),再打开输出文件,就可以清晰地看到优化一步后分子的构型,这样就可以随时监控过度态分子的结构,倘若已经有收敛到其他分子构型的趋势时,就可以把它给KILL了,而不至于需要等全部工作结束后,打开输出文件才知道已经不是想要的过渡态了。 如果收敛到其它的构型上去,可以考虑缩小OPT的步长.iop(1/8=23)即可。
   4.
还需要加其它的关键词吗?
   
建议在OPT中加入CALCFC。这样可以加大找到过渡态的几率。
   5.
如何控制寻找过渡态的步长?
   
这个可以用IOP来实现。具体相应的IOPiop(1/8)=2,此语句说明在找过度态的时候,以2AA为基本单位长度)为单位来寻找过渡态。

Gaussian进行溶剂计算

SCRF关键词,可以指定它给出的系列溶剂(默认为H2O
  
可供选择的有19种溶剂,可以在SCRF关键词里面查到,也可以写成
  SCRF=N (N=1
19,分别对应N所代表的溶剂)
  
也可以用自己设定的溶剂
  
但是要在输入它的介电常数和溶剂半径A0
  
介电常数可以查化学手册,A0可以用Volume关键词进行计算
  
计算方法可以选择PCMDipole两种模型
  e.g.
  # RHF/6-311++G(d,p) OPT=Vtight Freq SCRF(PCM,Solvent=4) Test
  
在甲醇溶剂中用PCM方法进行优化和频率计算

1月19日

《远大前程》(影片)简介

Great Expectations

  故事发生在19世纪的英国。在皮普还是个15岁的孩子时,父母双亡,和姐姐、姐夫生活在一起。圣诞节前,皮普到墓地去悼念父母,遇到了越狱犯麦格维奇。皮普为他拿来了蛋糕充饥,令麦格维奇非常感动,但最后他还是被警察带走了。

  圣诞过后,皮普被邀请到村里最富有的哈维汉姆小姐家做客。这个老妇人新婚当天丈夫没有出现,从此便再也没有脱下婚纱,多年来一直生活在回忆里。尽管她拥有财富,却从没有得到过幸福,因此一直活在愤恨中,性格怪癖。当皮普怀着忐忑不安的心情踏入这所老房子时,遇到了哈维汉姆小姐收养的女孩埃斯特拉,从此便一发不可收拾地爱上了她。但埃斯特拉是个傲慢又刻薄的女孩,根本不把皮普放在眼里。这令皮普很伤心,他暗自下决心要成为一名绅士好让埃斯特拉不再歧视自己。

  机会终于来了。尽管皮普的姐夫只是一个铁匠,没有钱送他上学,但在几年后,突然有不愿意透露姓名的人提出资助皮普到伦敦去过上层社会的生活。皮普满心欢喜地来到伦敦,学习如何社交、如何跳舞、如何成为一名真正的绅士。此时的皮普已明显的感觉到自己无法再和做铁匠的姐夫顺畅沟通了,尽管是姐夫把他养大,感情也非常好。

  埃斯特拉此时已长成亭亭玉立的少女从国外学习归来。皮普找到她,却发现她不断穿梭于许多男人之间并选择了其中一个成为她的丈夫。皮普痛苦得无法自拔。而此时在背后资助皮普的人终于出现了,他就是多年前被皮普搭救过的麦格维奇。他再次越狱后赚下了很多钱,他希望以资助皮普的方式感激他。但这次麦格维奇的出现没有以往那样幸运了,他被警察抓到死在了监狱里。皮普的财产也被没收,顿时成了穷光蛋。皮普无法接受这样残酷的现实,大病一场。

  康复后的皮普认真审视自己,决定从头做起。几年后皮普凭借自己的努力,成为了真正拥有财富的绅士。他再次回到姐夫家中,和家人共度这一年的圣诞节。皮普在老房子里遇到了生活并不幸福的埃斯特拉,得知她从一开始就深爱着自己,但她是被哈维汉姆小姐收养用作报复男人的,她不愿皮普受到伤害才选择和别人结婚。隐藏在心中多年的情感终于爆发,这对有情人最终走到了一起。  

  该片又名《孤星血泪》,英国文豪查尔斯·狄更斯的著名小说改编。查尔斯·狄更斯是英国伟大的小说家,他的多部作品都曾被搬上银幕,如《雾都孤儿》、《双城记》等。ustc影视上有1946年拍的版本,中央六套翻译配音,还不错。

12月15日

做理性的分析!

没有理性就不是人了,一定要学着很理性才是。
12月1日

Gaussian & Amber 对比。

Gaussian是做半经验计算和从头计算使用最广泛的量子化学软件,可以研究:
  分子能量和结构,过渡态的能量和结构,化学键以及反应能量,分子轨道,偶极矩和多极矩,原子电荷和电势,振动频率,红外和拉曼光谱,NMR,极化率和超极化率,热力学性质,反应路径。
  计算可以模拟在气相和溶液中的体系,模拟基态和激发态。Gaussian 03还可以对周期边界体系进行计算。Gaussian是研究诸如取代效应,反应机理,势能面和激发态能量的有力工具。

  Gaussian 98的功能有:
  基本算法
  可对任何一般的收缩gaussian函数进行单电子和双电子积分。这些基函数可以是笛卡尔高斯函数或纯角动量函数,多种基组存储于绦蛑校ü频饔谩;挚纱⒋嬖谀诖妫饨哟娲⑵魃希蛴玫绞敝匦录扑恪6杂谀承├嘈偷募扑悖扑愕幕ǚ芽梢允褂每焖俣嗉椒?FMM)和稀疏矩阵技术线性化。
  将原子轨道(AO)积分转换成分子轨道基的计算,可用的方法有in-core(将AO积分全部存在内存里),直接(不需储存积分),半直接(储存部分积分),和传统方法(所有AO积分储存在硬盘上)。
  能量
  使用AMBER,DREIDING和UFF力场的分子力学计算。
  使用CNDO, INDO, MINDO/3, MNDO, AM1,和PM3模型哈密顿量的半经验方法计算。
  使用闭壳层(RHF),自旋非限制开壳层(UHF),自旋限制开壳层 (ROHF) Hartree-Fock波函数的自洽场(SCF)计算。
  使用二级,三级,四级和五级Moller-Plesset微扰理论计算相关能。 MP2计算可用直接和半直接方法,有效地使用可用的内存和硬盘空间。
  用组态相互作用(CI)计算相关能,使用全部双激发(CID)或全部单激发和双激发(CISD)。 双取代的耦合簇理论(CCD),单双取代耦合簇理论(CCSD),单双取代的二次组态相互作用(QCISD), 和Brueckner Doubles理论。还可以计算非迭代三组态(以及QCISD和BD的四组态)的贡献。
  泛函数理论(DFT),包括LSDA, BLPY, Becke的1993三参数混合方法,Becke的1996单参数混合方法,和由此产生的变体,以及由使用者自行组合的Hartree-Fock和DFT的混合方法。
  自动化的高度准确能量方法:G1理论,G2理论和G2(MP2)理论;完全基组(CBS)方法: CBS-4, CSB-q, CBS-Q,CBS-Q//B3和CBS-QCI/APNO,以及一般CBS外插方法。
  广义MCSCF,包括完全活性空间SCF(CASSCF),并允许包含MP2相关作用计算。算法的改善使得Gaussian 98可处理12个以内的活性轨道。
  广义价键结-完全配对(GVB-PP) SCF方法。
  对Hartree-Fock和DFT方法计算在取消限制后,测试SCF波函数的稳定性。
  使用单激发组态相互作用(CI-Singles)方法,HF和DFT的含时方法,和ZINDO半经验方法,计算激发态能量。梯度和几何优化
  解析计算RHF,UHF,ROHF,GVB-PP,CASSCF,MP2,MP3,MP4(SDQ),CID,CISD,CCD,QCISD,密度泛函和激发态CIS能量的核坐标梯度。以上后-SCF方法可以利用冻结核近似。 使用内坐标,笛卡尔坐标或混合坐标,自动进行几何优化到能量最小或鞍点结构。不论输入结构使用何种坐标系统,优化计算的默认执行使用冗余内坐标。
  使用同步过渡引导的准Newton方法,自动进行过渡态搜寻。
  使用反应内坐标(IRC)计算化学反应路径。
  对能量和几何优化进行二或三层ONIOM计算。
  同时优化过渡态和反应路径。
  使用态平均CASSCF进行圆锥截面优化计算。
  沿着指定的反应路径对过渡结构定位能量最大点的IRCMax计算。
  直接动力学轨迹计算,其中的经典运动方程集成了解析二级导数。频率和二级导数
  对RHF,UHF,DFT,RMP2,UMP2,和CASSCF方法,和用CIS方法计算的激发态等的力常数(对核坐标的二次导数),极化率,超极化率,和偶极矩解析导数的解析计算方法。
  对MP3,MP4(SDQ),CID,CISD,CCD,和QCISD方法的能量或梯度的数值微分,计算力常数,极化率和偶极矩导数。 使用任意同位素,温度,和压强做谐振分析和热化学分析。
  决定振动跃迁的红外和拉曼光谱强度。
  分子特性
  使用SCF,DFT,MP2,CI,CCD,QCISD方法求解各种单电子性质,如Mulliken布居分析,多极矩,自然布居分析,静电势,以及使用 Merz-Kollman-Singh 方法,CHelp方法,或CHelpG方法由静电势计算的原子电荷。
  用SCF,DFT和MP2方法,计算NMR屏蔽张量和分子的磁化系数。
  振动圆二色性(VCD)强度。
  分子内原子理论的成键分析和原子性质。
  用传播算子方法计算电子亲和能和电离势。
  CASSCF计算中可计算两自旋状态间的近似自旋轨道耦合。溶剂模型所有这些模型使用自洽反应场(SCRF)方法模拟在溶液中的分子系统。
  Onsager模型(偶极和球反应场),包括在HF和DFT级别解析的一级和二级导数,在MP2,MP3,MP4(SDQ),CI,CCD和QCISD级别的单点能计算。
  Tomasi等人的解析HF,DFT,MP2,MP3,MP4(SDQ),QCISD,CCD,CID和CISD能量与HF和DFT梯度的极化连续重叠球状反应场(PCM)模型。
  在HF和DFT级别上,解析能量的IPCM(静态等密度曲面)模型。
  在HF和DFT级别上的SCI-PCM(自洽等密度曲面)模型,用解析方法计算能量和梯度,数值方法计算振动频率。
  2003年,Gaussian从98升级到03,参见Gaussian 03简介。G03W的界面和G98W相比,没有什么变化,G98W的用户不需要重新熟悉界面。
  Gaussian 03新增加了以下内容:
  新的量子化学方法
  (1) ONIOM模块做了增强对ONIOM(MO:MM)计算支持电子嵌入,可以在QM区域的计算中考虑MM区域的电特性。通过算法的改善,ONIOM(MO:MM)对大分子(如蛋白质)的优化更快,结果更可靠。ONIOM(MO:MM)能够计算解析频率,ONIOM(MO:MO)的频率计算更快。提供对一般分子力场(MM)的支持,包括读入和修改参数。包含了独立的MM优化程序。支持任何ONIOM模拟的外部程序。
  (2) 修改和增强了溶剂模块改善和增强了连续介质模型(PCM):默认是IEFPCM模型,解析频率计算可以用于SCRF方法。此外改善了空穴生成技术。模拟溶液中的很多特性。可以对Klamt的COSMO-RS程序产生输入,通过统计力学方法,用于计算溶解能,配分系数,蒸汽压,以及其它整体性质。
  (3) 周期性边界条件(PBC)增加了PBC模块,用于研究周期体系,例如聚合物,表面,和晶体。PBC模块可以对一维、二维或三维重复性分子或波函求解具有边界条件的Schrodinger方程。周期体系可以用HF和DFT研究能量和梯度;
  (4) 分子动力学方法动力学计算可以定性地了解反应机制和定量地了解反应产物分布。计算包含两个主要近似:Born-Oppenheimer分子动力学(BOMD), 对势能曲面的局域二次近似计算经典轨迹。计算用Hessian算法预测和校正走步,较以前的计算在步长上能够改善10倍以上。还可以使用解析二级导数,BOMD能够用于所有具有解析梯度的理论方法。提供原子中心密度矩阵传播(ADMP)分子动力学方法,用于Hartree-Fock和DFT。吸取了Car和Parrinello的经验,ADMP传递电子自由度,而不是求解每个核结构的SCF方程。与Car-Parrinello不同之处在于,ADMP传递密度矩阵而不是MO。如果使用了原子中心基组,执行效率会更高。这一方法解决了Car-Parrinello存在的一些限制,例如,不再需要用D代替H以获得能量守恒,纯DFT和混合DFT均可使用。ADMP也可以在溶剂存在的情况下执行,ADMP可以用于ONIOM(MO:MM)计算。
  (5) 激发态激发态计算方面做了增强:由于改善了在完全组态相互作用计算中求解CI矢量的算法,提高了CASSCF执行效率。对能量和梯度计算可以使用约14个轨道(频率计算仍是8个)。限制活性空间(RAS)的SCF方法。RASSCF把分子轨道分成五个部分:最低的占据轨道(计算中作为非活性轨道考虑),计算中作为双占据的RAS1空间,包含对所研究问题非常重要分子轨道的RAS2空间,弱占据的RAS3空间,以及未占据轨道(计算中做冻结处理)。因此,CASSCF在RAS计算中分成三个部分,考虑的组态通过定义RAS1空间允许的最少电子数和RAS3空间允许的最多电子数,以及三个RAS空间电子总数来产生。NBO轨道可用于定义CAS和RAS活性空间。对于对应成键/孤对电子的反键轨道可以提供相当好的初始猜测。对称性匹配簇/组态相互作用(SAC-CI)方法,用于有机体系激发态的高精度计算,研究两个或更多电子激发的过程(例如电离谱的扰动),以及其它的问题。CIS,TD-HF和TD-DFT的激发态计算中可以考虑溶剂影响。
  新的分子特性
  (1) 自旋-自旋耦合常数,用于辅助识别磁谱的构像。
  (2) g张量以及其它的超精细光谱张量,包括核电四次常数,转动常数,四次离心畸变项,电子自旋转动项,核自旋转动项,偶极超精细项,以及Fermi接触项。所有的张量可以输出到Pickett的拟合与光谱分析程序。
  (3) 谐性振-转耦合常数。分子的光谱特性依赖于分子振、转模式的耦合。可用于分析转动谱。
  (4) 非谐性振动及振-转耦合。通过使用微扰理论,更高级的项可以包含到频率计算中,以产生更精确的结果。
  (5) 预共振Raman光谱,可以产生基态结构,原子间连接,以及振动态的信息。
  (6) 旋光性以及旋光色散,通过GIAO计算,用于识别手性体系的异构体。
  (7) 电子圆二色性(ECD)。这一特性是光学活性分子在可见-紫外区域的差异吸收,用于归属绝对构型。预测的光谱还可用于解释已存在的ECD数据和归属峰位,
  (8) 含频极化和超极化,用于研究材料的分子特性随入射光波长的变化。
  (9) 用量度无关原子轨道(GIAO)方法计算磁化率,它类似于电极化率,用于研究分子的顺磁/反磁特性。
  (10) 预测气相和在溶剂中的电、磁特性和光谱。
  (11) ONIOM预测电、磁特性。
  新增加的基本算法
  (1) 更好的初始轨道猜测。Gaussian 03使用Harris泛函产生初始猜测。这个泛函是对DFT非迭代的近似,它产生的初始轨道比Gaussian 98要好,例如,对有机体系有所改善,对金属体系有明显改善。
  (2) 新的SCF收敛算法,几乎可以解决以前所有的收敛问题。对于其它极少数的不收敛情况,Gaussian 03提供了Fermi展宽和阻尼方法。
  (3) 纯DFT计算的密度拟合近似。这一近似在计算库仑相互作用时,把密度用一组原子中心函数展开,而不是计算全部的双电子积分。它用线性标度的算法,对中等体系的纯DFT计算可以极大地提高计算效率,而又不损失多少精度。Gaussian 03可以对AO基自动产生合适的拟合基,也可以选择内置的拟合基。
  (4) 更快的自动FMM方法,用于适中的体系(纯DFT约100个原子,混合DFT约150个原子)。

  (5) 对纯DFT使用更快的库仑能算法,节省库仑问题的CPU时间。
  (6) O(N)更精确的交换能量项。在Hartree-Fock和DFT计算中,通过删除密度矩阵的零值项来屏蔽精确的交换贡献。这可以节省时间,而又不损失精度。
  新增功能:
  (1) 新的密度泛函:OPTX交换,PBE和B95相关,VSXC和HCTH纯泛函,B1及其变体B98,B97-1,B97-2,PBE1PBE混合泛函。
  (2) 高精度能量方法:G3及其变体,W1方法。另外还包含W1BD,它用BD代替耦合簇,比CBS-QB3和G3更精确,当然计算也更加昂贵。
  (3) 对重元素全电子基组计算的Douglas-Kroll-Hess标量相对论修正,用于当ECP基组不能满足精度的情况。
  (4) 逼近基组极限的UGBS基组。

Amber是程序套件集合的名称,用于分子(特别是生物分子)的动力学模拟,并不是哪个具体的程序叫这个名称,而是很好地协调工作的各个程序部分一起提供了一个强大的理论框架,用于多种通用计算。AMBER提供两部分内容:用于模拟生物分子的一组分子力学力场(无版权限制,也用于其它一些模拟程序中);分子模拟程序软件包,包含源代码和演示。AMBER当前的版本是8.0 (2004)。
发布版包含了大约60个程序,它们相当好地协调工作。主要的程序有:
  sander:用来自NMR的能量限制模拟退火。可以基于来自NOE的距离限制和扭转角限制、基于化学位移和NOESY值的性能损失函数,进行NMR的精细化。Sander也是用于分子动力学模拟的主程序。
  gibbs:程序包含自由能微扰(FEP)和热动力学积分(TI),还允许平均力势(PMF)的计算。
  roar:进行QM/MM计算,“真正的”Ewald模拟,以及备用的分子动力学积分程序。
  nmode:使用一阶和二阶导数信息进行简正模式分析的程序,用于寻找局域最小值,进行振动分析,寻找过渡态。
  LEaP:X-window程序,用于基本模型,AMBER坐标和参数/拓扑文件的创建。它包含分子编辑器,可以创建基团和操作分子。
  antechamber:该程序套件对大多数有机分子自动产生力场描述。它从结构开始(通常是PDB格式),产生LEaP可识别的文件用于分子模拟。要求对蛋白质和核酸产生的力场与通常的Amber力场一致。
  ptraj和carnal:用于分析MD轨迹,计算参考结构的RMS偏差,氢键分析,时间相关函数,扩散特性,等。
  mm_pbsa:脚本,对MD轨迹自动后期处理,用连续溶剂方法进行热力学分析。它能够把能量归属到不同的基团片断中去,并估算不同构像之间的自由能量差。

  8.0版的新功能:
  1. 力场。加入四个新力场:基于连续溶剂环境量子计算,重新参数化的全部原子蛋白质力场(ff03);对分子的应用范围作了大幅扩充的普通Amber力场(gaff)适用于共轭体系;新版的多糖力场(glycam04);以及QM/MM工具,体系的一部分可以使用半经验方法(如AM1,PM3)得到的能量和力。
  2. 广义Born (GB)模型。新参数化后的Amber 8提高了Poisson-Boltzmann结果的精度,计算更快。GB模型可以使用局部增强取样(LES)方法,以及执行恒定pH模拟。Langevin动力学可以模拟溶剂摩擦的影响。
  3. 溶剂模拟。可以用考虑长程静电影响的Poisson-Boltzmann反应场模型进行非周期性模拟。溶剂的周期性计算较前一版本更快,在并行环境下标度更好。
  4. 取样与自由能计算:支持副本交换(或“多正则”)模拟,对模拟平均场的势和热力学整体自由能的方法进行改善。
  5. 连接到其它程序。Amber可以使用MD-GRAPE硬件,可以连接到Istvan Kolossváry的LMOD方法用于对接和构象分析。Amber组件还可以包含半经验量子计算和有限差分Poisson-Boltzmann计算程序。

9.0版的新增功能
1. 力场:多种新的力场类型,包括:对已有的f99和ff02蛋白质力场进行的升级,对肽和蛋白质的扭转参数做了改善;新的联合原子力场,使用与ff03全原子力场类似的驱动体系;扩充了gaff力场,增加了分子的适用范围,特别是对共轭体系;支持Ren和Ponder的AMOEBA极化势;半经验的价键模型,可用于对化学反应构造近似的势。
2. QM/MM模拟:QM/MM支持气相、隐含液相,以及周期边界条件模拟,体系的QM部分可以来自半经验方法,如MNDO,AM1,PM3,或PM3/PDDG。与早期版本相比,QM/MM改善了精度、能量收敛及程序的性能。气相或溶剂层的QM/MM模拟还可以用MNDO/d或SCC-DFTB哈密顿量。对已几百个原子的大型量子区,可以使用分而治之的线性标度方法,化学位移可以从半经验波函计算。
3. 广义Born模型:成对的分子体积校正,对于分子表面Poisson-Boltzmann和显式溶剂结果的符合程度,比以前的Amber GB模型更好。
4. 升级了Poisson-Boltzmann应用程序,包括:新的非键程序;基于显式溶剂自由能模拟,重新优化的原子空穴半径;改善了静电势显示选项;以及新的非极化溶剂模型用于直接处理弥散相互作用,可以极大地改善显式溶剂中非极化溶剂自由能的关联。
5. 拉皮筋的模拟方法,用于搜索复变换中的近似过渡态。自动导向的Langevin动力学方法可以加速构象搜索。
6. 路径积分分子动力学模拟,对核运动使用量子动力学而不是牛顿方程,用于简化平衡正则分布。
7. 用Jarzynski等式,从非平衡“靶向”或“拉伸”模拟估算自由能。
8. 升级了仿形交换方法,包括改善了标准仿形交换代码,并支持一些新的仿形交换方法,其中使用混合溶剂模型,对显式溶剂中的大体系可减少所需的仿形数量。
9. 对扩充的程序pmemd在速度和并行标度方面的一般改善,现在包含了广义Born功能。
10.sander,pmemd 和ptraj现在支持NetCDF二进制轨迹文件。与格式化的轨迹文件相比,二进制轨迹文件更小,精度更高,读写速度更快。NetCDF为文件可移植性提供了交叉结构,允许格式向下兼容,并使文件自说明。VMD 1.8.4支持此文件格式。(可惜最新的版本9卖到20000美元一套,很郁闷。

发现一个新的软件-Spartan

分子力学计算的一个新的软件,貌似不错的样子,好像德国科隆大学的计算科学中心也正在用,好好学一下,估计会有用。

Spartan'06 Essential for Windows

Ideally suited for academic teaching labs. The "Essential" edition includes the same easy-to-use graphical interface as Spartan'06 to access molecular mechanics and quantum chemical methds that have become modern chemistry education standards.

Available November 15th!!

软件说明:

图形界面的量子化学从头计算程序。
1. 理论方法:从头Hartree-Fork,密度泛函(局域密度近似,以及BP,BLYP,EDF1,B3LYP),MPn(MP2,MP3,MP4,LMP2),更高级的相关能计算(CCSD,CCSD(T),OD,OD(T),G2,G3),半经验方法(MNDO,MNDO(d),AM1,PM3),蒙特卡罗和分子力学。
  2. 计算类型:单点能计算,几何优化,组态分析,预测化学反应,平衡位置和过渡态寻找,水溶液的SM5.4能量计算,Mulliken和NBO的布居分析。
  3. 全部计算和结果的显示都在图形界面下完成。
  Spartan'04的新功能:
  1. 图形用户界面:
  从计算的IR数据绘制红外光谱图,从Hartree-Fock分子轨道理论绘制13C NMR图,Spartan分子数据库及搜索,显示氢键,产生和跟踪内反应坐标(IRC),输入和输出SDF,TGF,MOL各式的分子坐标文件,手性中心转置,用户控制动画速度,显示键型,在对话框中加入帮助功能。
  2. 计算功能增强(部分功能来自Q-Chem):NMR谱(用Hartree-Fock模型计算化学位移,DFT模型正在开发),紫外/可见光谱(用Hartree-Fock + CIS,或者DFT + TDDFT模型计算垂直激发能),构象搜索,内反应坐标。

11月19日

不想学量化了。

真烦人。希望丁mm能帮我,yeah,哈哈。
10月31日

记住了,乔,其实你什么都不是。

有时候生活中也许我们会高估自己,无论是能力还是地位,价值。都可能有错误的定位,所谓,要时刻提醒自己,别太高估了自己。你只是一个平凡的普通的人。
记住了,乔,其实你什么都不是。
10月27日

什么是科研?

最近心情有点小郁闷,到底什么是科研,就我们实验室来说,太沉闷乏味,做的课题没什么创新的意思,这样下去最多只能发几篇垃圾文章而已,该怎么办呢?
10月24日

X射线

X射线激光的发展和应用是当今激光科学技术发展中的重大前沿课题之一,独特的优点使得X射线激光在物理学、生物学、化学、材料学以及惯性约束聚核变(ICF)等领域有着巨大的应用前景。自从首次在实验室获得X射线激光的演示以来,就获得了广泛的关注和研究,不仅是X射线激光本身的研究,还包括在各方面的应用研究尝试。这么多,我该写什么才能交了这门课的论文呢?
10月21日

学会看着别人的眼睛说话。

听说这个很有意义,咱也要试着用用看。
10月7日

做个好人!

从今天起,用心看书,做个好人,忘记该忘记的事,不做不该做的事!
8月31日

白领男士的腹部健身法

据调查的体质普遍较虚弱,经常易患流感,头痛等症,而且由于他们的身体“动感”不足,久而久之,皮下的脂肪组织往往会很放肆地进行“集会”,造成他们下腹部隆起,臀部肥大等肥胖症状.

  日本的临床医师指出:肥胖不仅有损白领男士的外表形象,而且对健康构成了莫大的威胁,例如:被称为生活习惯性疾病的脂肪肝、高血压、糖尿病等很有可能会找上门来.

  为了切实防止体内多余脂肪的滋生,防止其在机体内兴妖作怪,日本的运动医学专家给白领男士安排了一组有效的简易徒手操,只要每周练习2-3次,下腹部那易生成组织的地方,会产生坚韧有力的肌肉组织来,这样,身体会变得健美,人会感到精力充沛,可以使人高效率地应付好每天的工作,具体方法如下:

  一、仰面平躺,以脚紧紧地并拢,且上抬10厘米,保持此动作约10秒钟,再把双脚放下,将这套动作重复做50次,若做100次效果会更理想。


  二、身体躺平,双脚并拢,膝关节弯屈,双手交叉放置脑后,旋转颈部,面岳,头部略向上抬,视线投向自己的膝部,头向上运动50-100次。

  三、面向前坐在椅子上,上身挺直,双手紧扭椅子两端,双脚并拢,面后上提,将该支作保持10-20秒钟,然后放下,这套动作重复做100次为妥。

资讯来源:21CN

关于健身(转)

(1)进行有效的锻炼:为使腹部减少而采用无限制节食、裹腹的方法不仅达不到强健腹部肌肉的作用,反而会影响人的健康。应多参加体育锻炼,如跑步、爬山、骑车、游泳、打球等,可使腹部脂肪减少。

  (2)适当节制饮食:少吃糖、淀粉、动物脂肪等,以吃七分饱为度,这样可促进体内脂肪的消耗。

  (3)多做腹部健美操:盘腿而坐,手握一重物置于脑后。举起重物至头上,同时呼气收腹,上臂放松、将手放回脑后,同时吸气,放松腹肌。反复做8-12次。两足踝靠紧,平躺在垫子上,双脚固定住。手伸直在头顶处,用力坐起,手触足尖,然后上体缓慢后倒。反复做10次。双手握在门框上,使身体悬空,然后用力收腹,双腿伸直上举,使腿与躯干成90摄氏度,停留片刻再缓慢放下复原。反复做5-10。自然站立,左手轻按腹部,右手放在脑后。慢慢吸气收腹,同时左手向内压腹部,憋一会气,再呼出,使腹肌逐渐放松并向前拱起,反复做10次。

  (4)腹部按摩减肥法:此法是简单有效的方法。它同时还适合于消化系统、神经系统和泌尿生殖系统的许多疾病,又可作为消除腹部脂肪、强健身体的一种方法。这种操作方法有简单易学,并感觉舒服、见效快等优点。操作时肥胖仰卧于床,解开扣和裤带,腹部只穿一件薄衣服。让家人面对肥胖者坐于左侧床边上。首先用波浪式的推压法从上腹移到小腹3-4遍,然后依次用三指叠按于腹部上中下部,每部按2-3遍。但饭后或特别饥饿时不宜操作。慢性病在按摩一个月后,休息几天再按摩。按的轻重以手下有脉搏跳动和病人不痛为宜。
  另有一法即将两手手指并扰,向前伸直,左手掌置于右手指背上,右手掌指平贴腹部,用力向前推按,继而左掌用力向后压,一推一回,由上而下慢慢移动,似水中的浪花。

  (5)涂抹摩脐法:肥胖者仰卧,家属站其旁,在施术部涂上凡士林或食用油以增加手法疗效。用手掌和掌根在腹部做按揉2-3分钟,再用双手掌根顺时针从升结肠、横结肠、横结肠、降结肠、乙状结肠部位做按揉法,约3-4分钟,手法以泻为主;与可兼用平补平泻,此法可调节胃肠蠕动功能,健脾利湿,加快皮下多余脂肪分解。同时可在中脘、气海、水分、关元、子宫、天枢穴,反复点、按、拨,以泻为主,从而达到减肥目的。

  (6)下腹部脂肪指压法:腹部是脂肪堆积的主要部位,而男性在肚脐上方聚焦的居多,女性则以肚脐下居多,若指压下腹部时,要稍用力使手掌充分弯曲,垂直下压15秒钟;若指压侧腹部点时,须将手掌充分弯曲分别置于左右侧腹上,沿水平方向稍用力缓慢按压15秒钟。
男性人体健美的标准
从古至今人们都执著地追求人体美,但是,由于人们所处的时代不同,文化程度、社会经历、职业、性别、年龄、民族等的差异,对什么是人体美却都有着各不相同的看法。

  我国体育美学研究人员胡小明根据中国的实际情况提出了如下人体美的标准:“骨骼发育正常,关节不显粗大突出;肌肉均匀发达,皮下脂肪适当;五官端正,与头部配合协调;

  双肩对称,男宽大圆;脊柱正视垂直,侧看白度正常;胸廓隆起,正背面略呈V形,女性胸廓丰满而有明显曲线;腰细而结实做呈圆柱形;腹部扁平,男子有腹肌垒块隐现;臀部圆满适度;腿修长,大腿线条柔和,小腿腓部稍突出,足弓高。”

  人体美是健、力、美三者的结合与统一,它包含了生长发育健康而又完善的机体,发达有力的肌肉,优美的人体外形和健康向上的精神气质。

  由于男女性别的差异,男女健美的标准理应有所不同,这里主要谈的是男性健美的标准。

  一、肌肉发达,体魄健壮:肌肉是人体力量的源泉,同时也是力的象征,因此,健美的体型、健壮的体魄是和发达的肌肉密切相关的。在艺术家、人类学家和体育家的眼里,发达的肌肉和健壮的体魄是人体美的重要因素。

  有了发达的颈肌能使人颈部挺直,强壮有力;发达的胸肌(胸大肌、胸小肌)能使人的胸部变得坚实而挺拔:

  发达的肱二头肌、肱三头肌及前臂肌群,可使手臂线条、鲜明,粗壮有力;

  覆盖在肩部的三角肌可使肩部增宽,加上发达的背阔肌,就会使躯干呈美丽的V形;

  有力的骶棘肌能固定脊柱,使上体挺直,不致弓腰驼背;

  发达的腹肌能增强腹压,保护内脏,有利于缩小腰围,增强美感;

  发达的臀部肌肉和有力的下肢肌肉,能固定下肢,支持全身,给人以坚定有力之感。

  总之,发达而有弹性的肌肉是力量的源泉,也是健美的象征。

  二、体型匀称,线条鲜明:体型主要反映人体的外部形象,无疑是构成人体健美的重要因素之一。

  从研究人体美的角度来看,以脂肪所占的比例,肌肉的发达程度,并参照肩宽和臀围的比例,作为划分体型的条件比较合适,这样可将体型分成胖型、肌型(或运动型)和瘦型三类。

  (l)胖型:其特点是上(肩宽)下(臀围)一般粗,躯干象个圆水桶,腰围很大。腹壁的脂肪很厚,在腰两侧下垂,腹部松软,肚脐很深。胸部的脂肪多而下坠,有些女性化。一般都短粗颈、双下巴。体重往往超过标志体重(身高-100)约30-50‰

  (2)瘦型;其特点和胖型相反,腰围很小,一躯干上小下大,肩窄,胸乎。四肢细长,肌肉不丰满,线条不明显。颈部细长,无双下巴。体重小于标准体重25一35%。

  (3) 肌型(运动型):其特点是肩宽、臀小,背阔肌大,上体呈倒三角形。腰围较细,腹部肌肉的显。四肢匀称,肌肉发达。颈部强壮有力,无双下巴。体重少于或超过标准体重5%左右。

  经常从事各项体育活动的人,特别是运动员,多为肌型(运动型)。他们身材匀称,肌肉发达,线条鲜明。

  知道了体型分类,就可通过健美锻炼来改善自己的体型,身体肥胖的通过锻炼来减肥,身体瘦弱的也可以通过健美锻炼来增加体重,力求使体格强健而匀称,肌肉发达而柔和。

  三、精神饱满,坚韧不拔:精神饱满其外在的表现是皮肤健美、姿态端正、动作潇洒,其内在的表现则是富有朝气、勇敢顽强、坚韧不拔;

  (1)皮肤健美。这是人体美的重要表征。苏联著名诗人马雅科夫斯基称颂结实的肌肉和古铜色的皮肤是世界上最美丽的衣裳。的确,皮肤是健康状况的镜子,红光满面气色好的人才有精神;相反,脸色发灰精神疲惫的人,往往是身体衰弱多愁善感的病人。红润光泽的肌肤和经常锻炼、适当的营养、正常的生活制度以及乐观的情绪等因素有关。我们应注意经常锻炼身体,保护好皮肤。

  (2)姿态端正,动作潇洒。中华民族有着悠久的文明历史,历来重视人的一言一行、一举一动。优美的坐姿应该是抬头、挺胸、直腰、收腹。切忌含胸弓背,因为这是造成脊柱弯曲、腰背疼痛的病因,而这样的坐姿也必然会使人显得精神萎靡不振。

  优美的站姿应该“三挺一睁”,即挺颈、挺胸、挺腿,两眼圆睁。要目视前方,头颈、躯干和脚在一条垂线上,两臂自然下垂。切忌弓腰挺腹,过分偏移重心至一腿的站姿。长期这样会造成脊柱变形、一肩低垂等毛病。

  优美的走姿不是一摇三晃,也不是八字横行,而应该保持身体在直、挺胸宜腰、微收小腹的姿态,膝和足尖始终正对前方行进,两臂自然摆动,步伐稳健而均匀。

  总之,优美的姿态和潇洒的动作。既符合人体解剖学和生理学的规律,又能给人以健美的印象。

  (3)勇敢坚定,坚韧不拔:中华民族历来重视人的精神气质,在赞美英雄的形象和力量的同时,总要更突出地称颂英雄的宏伟气魄。人是一个有机的统一的整体,同样,人体美也同外部表现的形体美和内在体现出的精神气质美的和谐统一,两者有机结合才能称得上真正的健美。因此,必须具有勇敢无畏的精神,坚韧不拔的顽强意志。刚毅果断的性格和良好的品德修养。这种美发自心灵深处,却又能通过人举一动、一言一行而在外部表现出来,并使得别人能够境受得到。这就要求在进行健美锻炼的同时,必须注意加强思想作风、意志品质、精神气质的锻炼和修养。

  总之,男性应该具有发达的肌肉、健壮的体魄、匀称的体型、魁梧的身材、端正的姿态、潇洒的风度,以及发自心灵深处的勇敢无畏、刚毅果断、坚韧顽强的精神气质的阳刚之美。 
8月30日

对如何阅读文献及写作综述的几点感受(转)

对刚刚入学的研究生或即将本科毕业的学生会遇到如何写综述的问题, 下面结合我的一点点经验和大家家流一下:
1. 如果你所要研究的领域在国内已经做了很多工作, 那恭喜你, 你可以很容易读到一些国内的综述或研究论文, 从而对你要从事研究方向有个基本的了解.
2. 如果你的研究方向比较偏门或者非常具有特色, 在国内还没有多多少工作, 那你就要费一番功夫了, 想入门不容易啊, 因为你直接面对的将是英文文献. 不说专业内容你不够了解, 就是那一堆堆的英语单词就够你受的了. 提供一个建议, 可以用
www.google.com 或许能搜索到一些台湾的中文期刊或硕博论文, 对你入门会有点帮助.

3. 在开始写综述之前, 你一定会下载一大批英语文献. 面对眼前一堆堆的文献, 又该如何下手呢? 我们想一下子全部消化掉, 那是不可能, 我们必须有的放矢, 采取一定的策略, 才能更好的消化那些文献, 才能写出精彩的综述文章.

首先, 先找出往年的经典文章, 即被其他Sci论文引用频率比较高的, 包括写的好的研究论文和一些综述, 尤其是写的好的综述特别要好好读. 简单介绍如何才能找到这些宝贵的文章
, 去ISI中找吧,
http://portal.isiknowledge.com/portal.cgi?DestApp=WOS&Func=Frame&Init=Yes&SID=W17Ebkdnd9ajdeBgekG

, 输入你的关键词, 找到相关的文章, 内有很多关于引用频次及其它重要信息, 从中选择应用率较高的研究论文和综述, 对于一些非常好的综述, 要想尽一切办法找到.
本论坛就有很多战友, 水平非常高, 他们一定非常热心的帮你找到全文. 推荐一个杂志:
Ameican zoologist, 内有很多写的非常好的综述文章, 可以找到研究研究.
http://www.findarticles.com/ 可以搜索到部分全文.

其此, 要找到近两年的文献, 写的比较好的研究论文和综述重点研究, 因为一篇好的综述文章一定会花很大精力重点介绍近两年的研究进展的, 内容才会新, 观点才会准确.

4. 经过3的选择, 所剩的文献就不会太多了吧, 对于一个新手来说也不会觉得压力太大, 剩下的就是好好消化这些需要重点读的文献了. 综述的写作思路还可以参考老外人家写的比较好的综述, 还可以引用人家的许多话, 当然最好对相关文献有所了解才比较好.

5. 可以着手去写吧. 先不管写出来的怎么样, 坚持写下去, 初稿一般比较粗糙, 需要好好的修改, 修改几次之后, 只要你文献引用恰当, 再经过你的老师修改润色, 写出的绝对是一篇不错的综述.


总结几句:
1. 看文献不能太急躁, 只要经典文献消化的好就能写的好;
2. 大批的文献必须要经过人为的筛选, 选取比较经典及更具价值的文献来读, 这样省时省力;
3. 重点研究国外综述能给予写综述的灵感, 及帮助你对本领域有价值文献的把握, 大大提高对其他文献的了解;
4. 重点引用近两年的文献, 会让编辑对你的综述另眼相看, 提高命中率;
5.增加对Nature, Science , Trends in...., PNAS, Annual review in .....,advance in .....等相关文献的了解, 因为这些文章简练, 信息量大且通俗易懂, 能够提高新手的阅读兴趣和提高对本领域的了解. 同时,其中也有很多比较经典的文献综述,更加需要一读了;
6. 根据自己的兴趣选择阅读一些文献,提高对某一角度论述的深度。

SCI论文写作全攻略(转)

SCI论文写作全攻略

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文章来源: 丁香园 - 论文写作和投稿交流天地 文章作者: flxu99   文章编辑: admin   发布日期: 2006-07-15 08:33 点击次数: 44
关键词: SCI 论文写作
(一)-选题与创新 
 一、先想先写最后做:
  1. 做研究之前,必须想清楚:结果能不能发表?发表在哪里?
  2. 先把文章大框写好,空出数据,等做完实验填完空就可以发了;正所谓心中有沟壑!
  3. 在未搞清“写什么、发哪里、自己研究与同类研究有何出色之处”之前,就不要动手做!
  4. 继续去看文献,去想;想不清楚就做还不如不做!
  5. 要想这样做,就得先看文献!要知道如何把文章架起来、要知道别人是如何讨论的、要知道自己的数据是不是说明了与别人不同的东东或别人没有做过……这个过程就是阅读文献及思考的过程,这些搞清楚了,写就简单了!
  6. 要是先做事,做完发现别人做过,或无法用理论来解释,岂不是冤大头?
  二、如何科学选题:
  1. 课题选择和国际接轨。想在国际核心期刊发表文献,就必须了解国际研究动态,选择与国际学术研究合拍的课题。由于多方面因素的影响,我国科学研究选题与国际先进水平还有一定距离。我国一家权威科研机构不久前在国内挑选了许多前沿领域的研究课题,准备参与国际合作,但到美国后发现近三分之二的课题已经不属前沿,在美国很少有人研究。在高校,一些教师治学严谨、基础扎实,但科研成果不突出,重要原因就是不重视有关领域学术动态,不能选得合适的课题。
  2. 课题要有可发展性。课题可发展性对高水平论文的持续产出具有极大作用。中国科技大学范洪义另辟蹊径,发展了诺贝尔奖得主狄拉克(Dirac)奠定的量子论的符号法,系统地建立了“有序算符内的积分理论”,1998年有24篇论文被SCI收录;他对自己论文高产的解释是,研究“具有开创性,突破一点以后就可以向纵深发展,使研究工作自成系列、成面成片”。我院被SCI收录论文最多的杨新民老师从事凸性理论研究,该理论兴起于 20世纪70年代,90年代进入高峰。作为新兴研究领域,该理论本身有许多尚待研究之处,同时该理论也可用来解决最优化方面的问题。反之,有人由于所接触的问题已处于该研究分支的末端,即使在该点上有所突破,也难持续发展。
  3. 借助工具选题:①查阅有关领域的检索工具,这些工具各高校都有;②了解SCI收录期刊所反映的科技动态,ISI期刊信息可从
http://www.isinet.com查获,也可从SCI印刷版每期A、D分册的来源出版物目录(Lists of Source Publications)查找,还可从ISI引用期刊报告 (Journal Citation Reports,简称JCR)了解期刊信息,该文献有印刷版、网络版(JCR on the Web)和光盘版 (JCR on CD-ROM);③利用ISI提供的选题工具,如能对正在开展的工作进行分析以保证用户科学研究同科学发展趋势一致(Essential Science Indicators),介绍有关最杰出人物研究状况、有关领域研究热点和发展趋向的(ISI Highly Cited.com);④利用网上数据库了解国际学术研究动态及有关资料。只要有心参与国际学术竞争,选择与国际学术研究接轨的课题并不存在难以克服的障碍。
  三、如何获得好的idea:
  无论是临床还是基础科研,最关键的是idea,idea的出台决定了科研水平和档次。高水平的科学家一听你的科研课题和方向,就能判断你科研水平。因此,获得好的idea是至关重要的。
  1. 优秀科学家要具备敏锐的科研嗅觉,而这种敏锐性是经过长期的思考和实践获得的。通过几天或半个月的苦思苦想得到了一个自以为很好的idea,很可能是别人十几年前就做过的工作。但新手上路时重复一些经典实验以获得经验是很正常的。此外,科研要注重质量,千万不要为单纯地追求数量而令懂行的人嘲笑。如何获得idea呢?
  A. 大量地、仔细地阅读文献,多听学术报告、多与同行探讨,从中获得启示,不能急于求成。
  B. 总结感兴趣领域内尚未探讨过但很有意义的课题;
  C. 总结争论性很强的问题,反复比较研究方法和结论,从中发现切入点;
  D. 善于抓住科研过程中遇到的难以解释的问题,往往会成为思维的闪光点;
  E. 细致地拟定方案,论证可行性。
  2. 获得idea的两种途径:传统途径就是先阅读大量科研论文,弄清目前的研究现状和要解决的问题等;非传统的途径是自己先冥思苦想一段时间,有了自己的idea后再去查文献。这样不会让以往的研究限制你的思维,不失为一个很好的方法。别人没作过的东西,也许不是因为别人没想到,而是因为没有意义或者没有可能性。
  3. 获得良好idea的基础前提:
  A. 在科研前必须弥补基础知识,这是看懂文献的基础:《生物化学》《细胞生物学》《基因VIII》必看(先看中文版翟中和《细胞》王境岩《生化》赵寿元《遗传》朱玉贤《分子》;再看英文的Albez《cell》赖宁格《biochemistry》还有经典的《gene 8》)。
  B. 广泛阅读文献是支撑。硕士至少查阅600篇,粗看300篇,细看100篇,研读50篇。博士至少再多一倍,并始终关注国际动态。《nature》《science》《cell》《PNAS》《JBC》《MBC》《Genes & Development》不放过,SCI-3分以上期刊应该耳熟能详!
  C. 学会阅读文献,读懂文章。建议先review再article,先中后英;中文只看《科学通报》《中国科学》,其他不看;看10-20篇review后看研究性论文。拿到一篇研究性论文,先看标题,立即停住,问自己几个问题:(1)想想别人这文章是怎么做的(可参考材料方法)?会做哪些内容来说明其标题?(2)明白他为什么要做这个吗?(3)如文章是近半年内发表的,该文章解决了什么问题?引出了什么问题(结合你看的综述)?接下来仔细看摘要,就知道你的想法是否与别人吻合?(4)看完实验结果,再思考有什么地方不完善?有没有深入或拓展到底?一般来说,SCI-3分以下的文章只可能做了一部分机理,下面肯定有东西可做,关键是你自己要思考,去发现。
  4. 长期作战持之以恒。做好上面所述要求肯定会有所谓idea,但过程艰辛,需长时间磨练,需要patience和passion。有天赋的人能考上海中科院生命科学院,北京中科院那几个所,北大、清华。耐心干5年,这些地方正为中国带来更多本土nature、science文章。
  四、博士如何出牛文章?
  1. 几点忠告:多看paper没有坏处;多找非老板的其他人,如其他教授,postdoc,前辈师兄等讨论,借鸡下蛋;可以动手的东西容易上手,比如软件等;找机会去开会,认认牛人,不发paper,做做volunteer,或者参加phd symposium之类。五主动参加seminar,自己讲几次看过的paper,最好自己组织一个topic拉几个师兄弟和postdoc参加,注意找几本教科书看看,打好基础。
  2. 如何获得IDEA:
  A. 需对研究的领域有一个全局性了解,按老板的话说是要有bird eye。
  B. 要有bird eye,需比较全面地阅读本领域文章。读文章要其idea,总结成一句话,并用卡片记录好,分类整理。如果把别人文章的idea总结成一句话,就容易理解它的本质,也好作变化。
  C. 读了很多文章后,可以写一个special study,将读过的本领域东西系统总结在一起,相当于你的综合理解,也就是bird eye看到的东西了。以后翻阅起来也相当方便。
  D. 用心分析对于别人的idea,任何一个idea都有weakness;想办法解决它,那就成自己idea。最好的办法就是看大牛的paper,无论他有多牛,他的文章总是在说一个方面,总有其他东西没有包括进去,把他的文章认真精读了,总会发现漏洞和不足或不全面之处,然后你就知道怎么做了。记住:每篇文章几乎都有没有考虑完全的东西。
  E. 时不时阅读更广泛领域的东西,扩大bird eye范围,对领域外的感兴趣的文章进行copy收藏,这个叫walk around a little bit,很多领域外的东西可以借鉴、学科交叉从而产生new idea。
  F. 经常跟牛人、博士后或高年级博士等有思想的人(最好不是相同专业,而是相关专业或交叉学科)讨论,也容易出idea。再有就是,关注其他专业的书籍、杂志等信息,从中获取交叉创新idea
SCI论文写作全攻略(二)-构思与撰文
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文章来源: 丁香园 文章作者: flxu99   文章编辑: 7100   发布日期: 2006-07-15 09:30 点击次数: 44
关键词: SCI 论文写作
  一、写作框架和各部分要求
  Title: Be short, accurate, and unambiguous; Give your paper a distinct personality; Begin with the subject of the study.
  Introduction: What is known; What is unknown; Why we did this study?
  Methods: Participants, subjects; Measurements; Outcomes and explanatory variables; Statistical methods.
  Results: Sample characteristics; Univariate analyses; Bivariate analyses; Multivariate analyses.
  Tables and figures: No more than six tables or figures; Use Table 1 for sample characteristics (no P values); Put most important findings in a figure.
  Discussion: State what you found; Outline the strengths and limitations of the study; Discuss the relevance to current literature; Outline your implications with a clear "So what?" and "Where now?"
  References: All citations must be accurate; Include only the most important, most rigorous, and most recent literature; Quote only published journal articles or books; Never quote "second hand"; Cite only 20-35 references.
  Formatting: Include the title, author, page numbers, etc. in headers and footers; Start each section on a new page; Format titles and subtitles consistently; Comply with "Instructions to authors".
  二、英文写作的语言技巧
  1. Introduction:
  A. 如何指出当前研究的不足并有目的地引导出自己研究的重要性?在叙述前人成果之后,用However来引导不足,提出一种新方法或新方向。如:However, little information(little attention/little work/little data/little research……)(or few studies/few investigations/few researchers/few attempts……)(or no/none of these studies……)has(have)been done on(focused on/attempted to/conducted/investigated/studied(with respect to))。如:Previous research (studies, records) has (have) failed to consider/ ignored/ misinterpreted/ neglected to/overestimated, underestimated/misleaded. thus, these previus results are inconclisive, misleading, unsatisfactory, questionable, controversial. Uncertainties (discrepancies) still exist……研究方法和方向与前人一样时,可通过以下方式强调自己工作:However, data is still scarce(rare, less accurate)or there is still dearth of……We need to(aim to, have to) provide more documents(data, records, studies, increase the dataset). Further studies are still necessary(essential)……
  强调自己研究的重要性,一般还要在However之前介绍与自己研究问题相反或相关的问题。比如:(1)时间问题;(2)研究手段问题;(3)研究区域问题;(4)不确定性;(5)提出自己的假设来验证。如果你研究的问题在时间上比较新,你可大量提及时间较老问题的研究及重要性,然后(However)表明“对时间尺度比较新的问题研究不足”;如果你的是一种新的研究手段或研究方向,你可提出当前流行的方法及其物质性质,然后(However)说对你所研究的方向方法研究甚少;如果研究涉及区域问题,就先总结相邻区域或其它区域的研究,然后(However)强调这一区域的研究不足;虽然前人对某一问题研究很多,但目前有两种或更多种观点,这种uncertanties或ambiguities值得进一步澄清;如果自己的研究是全是新的,没有前人的工作可对比,你就可以自信地说“根据假设提出的过程,存在这种可能的结果,本文就是要证实这种结果”等等。We aim to test the feasibility (reliability) of the……It is hoped that the question will be resolved (fall away) with our proposed method (approach).
  B. 提出自己的观点:We aim to//This paper reports on//This paper provides results//This paper extends the method//This paper focus on……The purpose of this paper is to……Furthermore, Moreover, In addition, we will also discuss……
  C. 圈定自己的研究范围:introduction的另一个作用就是告诉读者(包括reviewer),你文章的主要研究内容。如果处理不好,reviewer会提出严厉的建议,比如你没有考虑某种可能性,某种研究手段等。为减少这种争论,在前言的结尾就必须明确提出本文研究的范围:(1)时间尺度;(2) 研究区域等。如涉及较长的时序,你可明确提出本文只关心某一特定时间范围的问题,We preliminarily focus on the older (younger)……如有两种时间尺度 (long-term and short term),你可说两者都重要,但是本文只涉及其中一种。研究区域的问题,和时间问题一样,也需明确提出你只关心某一特定区域!
  D. 最后的原场:在前言的最后,还可以总结性地提出“这一研究对其它研究有什么帮助”;或者说further studies on……will be summarized in our next study (or elsewhere)。总之,其目的就是让读者把思路集中到你要讨论的问题上来。尽量减少不必要的争论(arguments)。
  2. Discussion:
  A. 怎样提出观点:在提出自己的观点时,采取什么样的策略很重要,不合适的句子通常会遭到reviewer置疑。(1)如果观点不是这篇文章最新提出的,通常要用We confirm that……(2)对于自己很自信的观点,可用We believe that……(3)通常,由数据推断出一定的结论,用Results indicate, infer, suggest, imply that……(4) 在极其特别时才可用We put forward(discover, observe)……"for the first time"来强调自己的创新……(5) 如果自己对所提出的观点不完全肯定,可用We tentatively put forward (interrprete this to…)Or The results may be due to (caused by) attributed to resulted from……Or This is probably a consequence of……It seems that……can account for (interpret) this……Or It is posible that it stem from……要注意这些结构要合理搭配。如果通篇是类型1)和5),那这篇文章的意义就大打折扣。如果全是2),肯定会遭到置疑。所以要仔细分析自己成果的创新性以及可信度。
  B. 连接词与逻辑:写英文论文最常见的毛病是文章的逻辑不清楚,解决方法如下。
  (1)注意句子上下连贯,不能让句子独立。常见的连接词有,However, also, in addition, consequently, afterwards, moreover, Furthermore, further, although, unlike, in contrast, Similarly, Unfortunately, alternatively, parallel results, In order to, despite, For example, Compared with, other results, thus, therefore……用好连接词能使文章层次清楚,意思明确。比如,叙述有时间顺序的事件或文献,最早的文献可用AA advocated it for the first time.接下来可用Then BB further demonstrated that. 再接下来,可用Afterwards, CC……如果还有,可用More recent studies by DD……如果叙述两种观点,要把它们截然分开AA put forward that……In contrast, BB believe or Unlike AA, BB suggest or On the contrary (表明前面观点错误),如果只表明两种观点对立,用in contrast BB……如果两种观点相近,可用AA suggest……Similarily, alternatively, BB……Or Also, BB or BB allso does……表示因果或者前后关系可用Consequently, therefore, as a result……表明递进关系可用furthermore, further, moreover, in addition……写完一段英文,最好首先检查是否较好地应用了这些连接词。
  (2) 注意段落布局的整体逻辑:经常我们要叙述一个问题的几个方面。这种情况下,一定要注意逻辑结构。第一段要明确告诉读者你要讨论几个部份……Therefore, there are three aspects of this problem have to be addressed. The first question involves……The second problem relates to……The third aspect deals with……清晰地把观点逐层叙述。也可以直接用First, Second, Third, Finally……当然,Furthermore, in addition等可以用来补充说明。
  (3) 讨论部份的整体结构:小标题是把问题分为几个片段的好方法。通常第一个片段指出文章最重要的数据或结果;补充说明部份放在最后一个片段。一定要明白,文章的读者分为多个档次;除了本专业的专业人士读懂以外,一定要想办法能让更多的外专业人读懂。所以可以把讨论部份分为两部份,一部份提出观点,另一部份详细介绍过程以及论述的依据。这样专业外的人士可以了解文章的主要观点,比较专业的讨论他可以把它当成黑箱子,而这一部份本专业人士可以进一步研究。
  C.讨论部分包括什么内容?(1)主要数据及其特征的总结;(2)主要结论及与前人观点的对比;(3) 本文的不足。对第三点,一般作者看来不可取,但事实上给出文章的不足恰恰是保护自己文章的重要手段。如果刻意隐藏文章的漏洞,觉得别人看不出来,是非常不明智的。所谓不足,包括以下内容:(1)研究的问题有点片面,讨论时一定要说,It should be noted that this study has examined only……
  We concentrate (focus) on only……We have to point out that we do not……Some limitations of this study are……(2)结论有些不足,The results do not imply……The results can not be used to determine(or be taken as evidence of)……Unfortunately, we can not determine this from this data……Our results are lack of……但指出这些不足之后,一定要马上再次加强本文的重要性以及可能采取的手段来解决这些不足,为别人或者自己的下一步研究打下伏笔。Not withstanding its limitation, this study does suggest……
  However, these problems could be solved if we consider……Despite its preliminary character, this study can clearly indicate……用中文来说这是左右逢源,把审稿人想到的问题提前给一个交代,同时表明你已经在思考这些问题,但是由于文章长度,试验进度或者试验手段的制约,暂时不能回答这些问题。但通过你的一些建议,这些问题在将来的研究中有可能实现。
  3. Others:
  A. 为使文章清楚,第一次提出概念时,最好以括弧给出较详细解释。如文章用了很多Abbreviation可用两种方法解决:(1) 在文章最后加上个Appendix,把所有Abbreviation列表;(2)在不同页面上不时地给出Abbreviation的含义,用来提醒读者。
  B. 绝对不能全面否定前人的成果,即使在你看来前人的结论完全不对。这是对前人工作最起码的尊重,英文叫做给别人的工作credits.所以文章不要出现非常negative的评价,比如Their results are wrong, very questionable, have no commensence, etc.遇到这类情况,可以婉转地提出:Their studies may be more reasonable if they had……considered this situation.Their results could be better convinced if they……Or Their conclusion may remain some uncertanties
三、撰写外刊论文的体会
  有人归纳了外刊论文撰写的五个基本要求,即5C:正确(correctness)、清楚(clarity)、简洁(concision)、完整(completion)和一致性(consistency) 。只有满足这5点,才算是一篇合格的外刊文章。
  1. Introduction:
  Introduction是外刊文章最难写的部分之一(另外就是Discussion)。中文文章的缺陷就在于Introduction没有内涵,过于简单,没有真正体现论文的研究起初和创新要素。外刊论文对于Introduction的要求是非常高的,一个好的Introduction相当于文章成功了一半。所以大家应该在Introduction的撰写上下功夫。要写好Introduction,最重要的是要保持鲜明的层次感和极强的逻辑性,这两点是紧密结的,即在符合逻辑性的基础上建立层层递进的关系。
  A. 阐述自己研究领域的基本内容。要尽量简洁明了,不罗嗦;须知看文章者都是该领域的专家,所以一些显而易见的知识要用概括性的而不是叙述性的语言来描述。
  B. 文献总结回顾。是Introduction的重头戏之一,要特别着重笔墨来描写。一方面要把该领域内过去和现在的状况全面概括总结出来,不能有丝毫的遗漏,特别是最新的进展和过去经典文献的引用(这是两个最容易出问题的地方,要极力避免;一旦审稿人指出这两个毛病,很可能意味着表明你做的不够深入或全面,负面作用非常明显)。另一方面,文献引用和数据提供一定要准确,切记避免片面摘录部分结果而不反映文献的总体结果;引用的数据也要正确,特别是间接引用的数据(即不是从原文献中查到,而是从别人文献中发现的另一篇文献的数据);数据出错会导致文章的印象特差!此外,引用文献时注意防止造成抄袭的印象,即不要原文抄录,要用自己的话进行总结描述。如果审稿人正好是文献的引用者的话,原文照抄的结果一定会很糟糕。
  C. 分析过去研究的局限性并阐明自己研究的创新点。这是整个Introduction的高潮,因而要慎之又慎。阐述局限性时,需要客观公正评价别人的工作,不要把抬高自己研究的价值建立在贬低别人的工作之上(这是中文文章易犯的毛病),外刊论文写作万万不可如此,一定要遵循实事求是的原则来分析。在阐述自己的创新点时,要紧紧围绕过去研究的缺陷性来描述,完整而清晰地描述自己的解决思路。需要注意文章的摊子不要铺的太大,要抓住一点进行深入的阐述。只要能够很好的解决一个问题,就是篇好文章;创新性描述的越多越大,越容易被审稿人抓住把柄。中文文章的特点是创新性要多要大,而英文文章的特点恰恰相反,深入系统的解决一到两个问题就算相当不错。
  D. 总结性描述论文的研究内容,可以分为一二三四等几个方面来描述,为Introduction做最后的收尾工作。 至此,Introduction的写作算是大功告成。但是写完之后,还是要慎之又慎的仔细修改,琢磨每一个句子是否表达得恰当准确,这对Introduction的修改完善至关重要。
  2. Methods:
  Methods部分描述论文实验过程,这一过程的写作相对较为简单,但是需注意的问题不少,重要的在于完整和科学。完整就是实验当中的每一个环节都要注意到,不要顾此失彼,遗漏一些重要内容。Methods部分可按实验对象、实验设备、实验材料、实验记录、实验分析方法等来组织行文。只要能在以下4个方面做到完整和科学的描述,相信写好Methods不是主要问题。
  A. 实验对象一般是人、动物或一些组织等,它们的基本信息要描述明确;此外要注意国外刊物大多对牵扯到人或动物的实验都有一些特定要求,有些是不允许在人或动物身上进行的实验操作,这需要认真阅读投稿刊物中关于实验的详细规定;如果违反这一规定,可能会不接受评审或发表。
  B. 实验设备,要对仪器型号、生产厂家、实验过程中的用途等作详细说明;实验设备之间的连接要科学正确,不要给人混乱或操作错误的感觉。设备使用时一些必要的步骤不可或缺,尤其是可能对实验结果造成特定影响的操作更要详细说明。这样做的好处是为了在Discussion中能够进行对应的分析。比如,一些设备在使用前要校正(calibration),有的要求每阶段实验之后都要重新校正,以保证结果的正确性;一定要详细说明你的操作步骤或校正过程,便于评审人分析你的结果。
  C. 实验材料,不同学科有不同要求。总体上来说要注意说明材料选择的必要性,也就是对为什么要选择这种材料,最好有一定的说明。如果这点描述不清,可能会导致整个实验过程不成立。
  D. 实验过程,就是清楚描述实验的整个操作流程,一般要附以实验流程图进行说明。流程图的画法很多,有文字式的,有文字和示意图结合的,不同实验有不同做法。一般来说,可能后者多一些(实验性学科尤其如此),因为这样能使评审人对实验过程一目了然。如果示意图画得漂亮,还可以增加一些印象分。描述时要有鲜明的层次感,对每个步骤之间的顺序和关联要描述清楚,不要造成实验过程混乱不堪的印象,因为评审人最终判断你的实验是否合理,是从这个过程描述得来的。
  3. Results:
  有人把Results和Discussion放在一起写,但是大多数论文都是分开的。这两种做法取决于文章的类型。如果你的结果在分析的同时进行讨论更加合适,并不适合单独拿出来分析(或者是那样做很困难,导致Discussion成为鸡肋时),合在一起是合适的;反之就应该分开写。
  A. Results的要求是翔实准确。准确是结果必须是真实的,不能伪造和篡改。翔实是提供最全面的分析结果,把一切从实验中得到的结果都提供给读者,不要故意隐瞒或遗漏某些重要结果。从某种意义上来说,结果不够翔实并不导致论文直接被拒,但结果的真实性被怀疑文章就肯定被拒。
  B. 结果提供一般是表和图。不同杂志对图表要求不完全一致,应根据杂志要求分别对待。表格能清晰展示论文获得的第一手结果,便于后人在研究时进行引用和对比。图示能将数据的变化趋势灵活的表现出来,更直接和富于感染力。图表结合,能取长补短,使结果展现更丰富。目前,大家越来越喜欢提供各种各样的图,但杂志却要尽量限制图的个数;因为会增加排版的困难,版面费和出版社的支出也就会增加。因此,建议大家在提供图时,尽量用最少的图提供最多的信息,最多不超过8个。图片太多显得罗索和累赘,主编不会欣赏;必要时可用表格替代一些图。图片格式要求每个杂志不同,用tif格式较多,不推荐用bmp(jpg更不能用)。有人说用矢量图清楚些,其实和tif没什么区别,只要足够清晰就行。黑白图片可免费,彩色图片绝对要收费,而且价格不菲。
  C. Results和Discussion分开写时,Results部分尽量不要涉及对结果的评论,最多是总结陈述结果就可以了。否则造成这两部分的内容重叠,显得累赘,从而对Discussion不利。结果的描述也要注意层次安排,要按照条理性要求分别描述,显得逻辑性较强。不要乱七八糟,降低论文的可读性。
  D. Results中大多要提供统计结果。方差分析的结果形式要根据刊物的格式给出,有的要求对分析值、自由度和概率都要详细的给出,有的只要分析值和概率就可以了。概率可以用p=0.02或者p<0.03等形式给出,自由度的表达也有特殊要求。这些细节问题虽然关系不大,但是注意格式统一,不要乱七八糟各自为战。统计分析结果过多时,可用表格给出,具体可参照SPSS软件分析之后的结果。如果论文结果部分通篇都是统计分析的数据,会显得凌乱不堪,表格可以避免这种情况。
  4. Discussion:
  Introduction和Discussion是最难写的两部分。Discussion之所以难写,是因为这里面最能够显示一个作者研究问题的深度和广度。深度就是论文对于提出问题的研究到了一个什么样的程度,广度指是否能够从多个角度来分析解释实验结果。要写好Discussion,大概可以分为下面两个步骤:
  A. 选择要深入讨论的问题。Results中有的结果是重要的,有的则可一笔带过。选择合适的结果在Discussion部分进行深入讨论,是写好该部分首先要面临的问题。一般来说,可根据如下原则来判断:如果你的结果体现了实验的独特性,是其他研究中没有得到的,那这个结果就是要重点讨论的问题;有些结果和前人的研究一致,并没有显著性差异,就应该一笔带过而无需深入讨论。Discussion的一个重要作用就是要突出自己研究的创新性,并体现出显著区别于他人的特点,区别大和小是另外一个问题,重要的是要有区别、区别就是创新。
  B. 对选中的问题按一定层次从多个角度进行讨论,说理要有根据、问题要讲清楚、讲透彻。选择的问题有时不只一个(多数情况是2个以上),因此要按一定层次描述清楚。一般来说,把最重要的放在中间,次之的放开头和末尾。放在中间能将评审人的情绪带至高潮,前面是铺垫,后面是总结。这样的顺序似乎更合适。问题无论大小,是否重要,都要从多个角度展开深入讨论:(1)首先要有类似结果的对比,说明自己结论的独特性;(2)其次要系统阐述为什么会有这样的结果,方法有多种(从实验设计角度,从理论原理角度,从分析方法角度,或借鉴别人分析方法等等)。重要的是将这个问题深入阐述清楚,不能让人有意犹未尽之感(要做到这点的确很困难,因为评审人总会提出新的问题,我们只可能尽量做到这一点罢了)。
  C. Discussion部分还要注意保持和Results的一致性!就是结果和讨论要一一对应。千万不要出现按讨论的内容可以推出与实验相反的结论这种情形,那证明你的讨论思路是彻底的失败或你的实验压根儿就是失败的。所以Discussion的文字描述和语言表达的精确性尤为重要。由于中英文表达的不同,在投稿之前要尽量避免出现表达上的误解,如果论文因此被拒是很冤枉的。
  5. Acknowledge & References:
  Acknowledge主要分为两个:第一是表明研究的基金来源,中国一般都是Nature Science Foundation of China(NSFC,国家自然科学基金),美国大多是National Institute of Health(NIH,美国国家卫生研究院)。写基金时一般要标注清楚基金号码(Grant Number),只有这样才算是该项基金的研究成果,也可以算做实验室的研究成果。须知没有任何一项研究成果是在没有资金资助的情况下完成的,所以这一点非常必要。第二是对参与人员(没有列在作者中的研究人员)和单位表示感谢,如果通过一审和最终接受发表,还要添上对editor和anonymous reviewers的感谢,这是基本礼貌。
  References重要在于格式。不同杂志对参考文献格式要求不一样,具体下来有所区别的可以分为:作者的写法,有的是简写在前,有的简写在后,有的简写有点,有的简写没有点;文章的名字,有的要加上引号,有的没有引号;期刊的写法,有的要简写,有的要全称,有的要斜体,有的则不需要;年和期卷号的顺序,有的是年在前,有的是年在后;期刊论文、书、学位论文、会议论文,四种引用的格式各不相同;文献的排列顺序,有的是按照字母的顺序,有的则是按照在论文中出现的顺序用阿拉伯数字排序。基本上就是这些问题,看来很是琐碎,但是如果你的参考文献排列的乱七八糟,那就会使得评审人对你论文的印象很差,认为你没有认知组织和撰写论文,造成一定的负面影响。所以,事情虽小,影响却大,还是要认真组织为好。
  此外,论文在撰写时要自始至终都用英语写,千万不要先写中文再译成英文。这样写出来的文章肯定是中不中,英不英,而且极大浪费精力。宁可一开始写得语法差一些,慢慢修改都比这种写法好。如果有同专业英语比较好的人帮助的话,这样写还会更省事。写作时行文时态要注意,中文没有时态问题,英文有,而且要求还相当严格。一般来说,大多数情况下是过去时态,在Introduction文献回顾,Methods整个部分,Results结果总结,Discussion中的大部分,都用过去时态陈述。其他情况下可以用一般时态来描述。时态之间的界限是比较严格的,最好是仔细的通读国外的论文,好好分析一下,或者让有经验的人帮你把把关,这样比较好一些。
四、Writing Skills in English for Research Paper
  写paper注意九个环节:Preparation, Structure, Title, Abstracts, Introduction, Conclusion, Body of Paper, Recision, Acknowledgement。Preparation就是收集资料,找出灵感和方向,主要依靠的是journal in library。Structure是重点,paper的structure应该是两个triangle组成的:上面一个倒三角,下面一个正三角,意思就是选题要宽(wide),研究方向要窄,然后最后的conclusion又发散开来。在paper的body前后都必须有declarative statement,用最少的字句表达出自己的观点,吸引读者。
  Title必须清晰简短(clear,short),表达出自己唯一的topic以提升读者的兴趣(promote the interest of reader),然而title中切记不能出现abbreviation和自己的result。
  Abstracts是paper的一个缩写(miniature of whole paper),一定要简明扼要(less than 200 words,one paragraph),按照paper的顺序介绍主要研究对象(subject)、实验设计(design)、实验步骤(procedures)以及最后结果(results),这种介绍必须让非专业的人员能够(non-specialist)看懂。
  Introduction同样要保证简短,顺序是一般背景介绍、别人工作成果、自己的研究目的及工作简介,其中介绍别人工作时只需介绍和自己最相关的方面(very relevant),而对自己的工作介绍不用说明细节,因为这个要放到body中去。不要忘记在介绍自己工作之前要有一个declarative statement。
  Body部分可以分为methods、result和discussiong三个部分:①Methods,详尽的介绍自己的实验方案以便于他人能够重复自己的实验过程,对于通用的实验方案可以简略,重点要放到自己的独创方案上面(own procedures),按照实验的先后顺序介绍,为了文章的阅读方便,不要使用过多层次的subheadings,比如subsubsubsection等等。②Result,使用text、table、figure等手段表达出来,其中table不要使用过多,而figure必须保证图线清楚、注解明确,必要的时候还要对于自己的result中的一些结论进行解释说明。③Discussion,这个部分是为了以后的study,在其中提出自己的problem或者是hypothesis,和别人的成果进行比较,暗示自己的主要收获,为后面的conclusion做准备。
  Conclusion中不要包含body以外的information,保持brief、neat和concise,一定要舍得结束自己的paper;如果自己的paper只是project的一部分,稍做说明。Revison是在写完之后回头看看是否有逻辑上的错误,是否考虑到了读者兴趣,自己的declarative statement是否令人满意,Brevity is the soul of literary construction。Acknowledgement,不要忘记,这个反应了一个人的个人品质。
  五、How to Write an Article by Gill B
  We very much welcome articles written by forumers, whether historical, strategic or about castles. Hopefully you will find a few hints and a bit of advice here which will help.
  1. Before you do anything at all, check that nobody is already writing a similar article. You don't want to spend a long time on research and writing only to find that someone else has already written about the same thing. Probably, for simplicity, you should mail your idea to me and I can check with the right person.
  2. It helps if you can write in clear and correct English. However, if English isn't your first language, don't let this put you off. I am happy to edit/proof read/anglicise what you have written.
  3. Look at previous articles on the site to see the sort of thing we like. Historical articles need to be factual, but not too dry. Strategy/design articles need to be accurate. Both need to be about something not already covered on the site.
  4. Your article needs to be original. You will need to do a lot of research on the web and/or in books. Of course you can use the information you find, but it will need to be rewritten in your own words. If you are using the internet for your research, try to find at least two sites confirming the information as there are some very inaccurate websites out there - we don't want to be one of them.
  5. If at all possible you will need illustrations for your article.
  a) If they are your own photos, drawings or screenshots, that's great.
  b) If you need an image of a unit, commodity or building from the game, there's a good chance we will already have an image uploaded somewhere.
  c)If you want to use an image from another website, you will have to write and ask permission. Do this politely; explain about the article you are writing, tell them that there will be a link to their site and send them a link to Stronghold Heaven so that they can see where their images will be used. If you are lucky, they will reply straight away giving you permission. More likely they will not reply at all, in which case you will need to look elsewhere. Please note that, for these purposes, HeavenGames is considered a commercial site (because we make a little money on the adverts, not a lot, but it's the idea that counts). This means a lot of pics that are in 'public' domain, will not be available to us, as they are for non-commerical use only. Permission to use external images is mandatory and we may need to see it before your article can be uploaded. We do have blanket permission to use images from some Castle Sites as long as they are credited, which might help you in your search.
  6. The final bit.
  a) When you have written your article and are happy with it, send it to me, preferably as a .txt file (though a .doc file is OK), together with any images you want to use. If the images are external, let me have the url where they can be found. Indicate in the article where you want each image to be.
  b) I (or another angel) will edit it and query with you anything we don't understand, then we will code and upload the article and you will be sent the url so you can have a look and see if you are happy with it.
  c) If not, we'll work on getting it how you want it; if so, it will be newsed and linked in to its appropriate place.
六、撰写论文初稿(writing the first draft):
  (1)材料和方法(methods and materials):做了什么和怎样做?材料和方法是文章开始写作的最理想部分,这部分的内容作者最了解。写作要求:用过去时,尽可能按实验的先后顺序描述。
  (2)结果(results):发生了什么?基本写作要求:可用图、表或文字表达,三者间尽量减少重复。在正文部分叙述主要结果和意义,用图或表给出较详细的数据,用过去时。
  (3)讨论(discussion):所得结果是否为“前言”提出的关键问题的答案?结果是如何支持答案的、如何证实假说的?基本写作要求:集中讨论与本结果有关的问题,突出本研究的创新及重要性,;与相关研究结果进行比较分析;给出结果所支持的结论;指出前景、不足和改进。用现在时叙述已知或被证明的事实,用过去时描述本研究结果。
  (4)文献(references):与本研究方法、结果、讨论有关的其它研究有哪些?准确完整规范著录。
  (5)前言(introduction)本研究的背景和目的是什么?试图回答的关键问题是什么?基本写作要求:本研究之目的和重要性;简要复习文献。
  (6)致谢(acknowledgment):除了作者,谁协助完成了本研究、分析结果并撰写论文?谁提供了基金和物质帮助?写作要求:仅列出对本工作提供特殊的实质性贡献者姓名;须得到被致谢者同意。
  (7)摘要(abstract):论文告诉我们什么(通常<250字)?摘要是论文要点的浓缩,应在文章各主要部分完成后再写,这样有利于文章要点的提炼。优秀的摘要能有效抓住读者兴趣。写作要求:用含有必要词汇的短的简单句,以使摘要清楚而简洁?避免使用缩写词和晦涩难懂的词句;用小标题叙述研究论文的各部分;用过去时(但问题的陈述和结论可用现在时);强调研究的创新和重要方面。
  (8)文题(title):本文关于什么?最佳文题的标准是用最少的必要术语准确描述论文的内容。写作要求:准确(accuracy)、简洁(brevity)、有效(effectiveness)和吸引人。
  (9)作者(author list):谁参与了本研究的设计、工作及论文的撰写?
  (10)准备论文最后一稿(preparing the final manuscript):论文初稿完成以后,必须对内容及格式进行反复推敲和修改,达到“投稿须知”的一切要求。绝大多数有经验的编辑都认为:不认真准备的稿件绝不是高水平科学研究成果的良好载体(A poorly prepared manuscript is,almost without fail,the carrier vehicle of poor science. Day AR.)。如果希望论文发表,在准备投稿时必须做到打字整洁、无错、符合期刊格式、含有期刊要求的所有材料。该过程一般分三步:再次阅读拟投期刊的“投稿须知”;用“投稿须知”中提供的“稿件对照检查表”(manuscript checklist, author's checklist)与自己论文一一核对;根据期刊要求打印输出,完成最后一稿。
  七、英语学术论文写作的几个细节
  A. 时态:当提到本文、此图、此表等说明了、表达了什么时要用一般现在时,而不用一般过去时。This paper describes ……The focus of this paper is ……Figure 1 shows ……Most of the common condensation polymers are listed in Table 1-1.
  B. 数:在学术论文里,有时很难顾及数的逻辑。但一般不将逻辑上的问题视为语法错误。只须注意在一个句子中的数和谓语动词的统一即可。单、复数的选用有一些非定性、但可供参考的趋向:
  ◆◆当含意上强调复数时建议用复数。The catalyst concentrations for the different reactions are different.Our research focuses on the syntheses and characterizations of a series of polycarbonates with different chemical structures.The physical and chemical properties of this compound have been studied.The chain lengths of the oligomers with different molecular weights are different.
  ◆◆当含意上不强调复数时可用单数或复数。Our research focuses on the synthesis of polycarbonates.The property of the compounds in group 1 is different from the property of the compounds in group 2.The chain length of the oligomers increases with increasing reaction time.
  ◆◆在标题、小标题中或描述一类事物、现象等,提到具体物质时常用复数。【Polyesters】Polymers are macromolecules built up by large numbers of small molecules. The small molecules which combine with each other to form polymer molecules are termed monomers.在标题、小标题或描述一类事物、现象等,提到抽象概念时可用单数、也可用复数。【Step Copolymerization】Newer Types of Step Polymerizations. This chapter will consider the characteristics of step polymerization in detail.
  ◆◆学术论文、有关学术的科普文章中的名词的可数或不可数特性的划分区别于非学术文章《非学术文章中的可数或不可数特性可从字典查到》。以下是在学术文章中通常视为可数名词的单词:《但在一般字典中它们或它们做某种含义解时可能被划归不可数名词》。
    application     development     consideration
    composition     concentration     distribution
        structure     length       weight
  ◆◆当同时提及几个图、表、方程式时要用复数(分别单个地提及则不用):The reaction rate constant can be calculated from Equations 2 and 3. The reaction rate constant can be calculated from Equation 2 and Equation 3. Figs. 4 and 5 show ……
  C. 冠词:
  ◆◆单数名词前一般要加冠词:a , the等; 但以下情况可不加:表示不特指的、较抽象的概念:
  This chapter will consider the characteristics of step polymerization in detail. An understanding of the relative ease of cyclization or linear polymerization comes from a variety of sources.Different polymers are synthesized to yield various mechanical behaviors by the appropriate combinations of crystallinity, crosslinking, Tg, and Tm..但需注意这些单词前加冠词也是经常见到的,这是由它在句中的含义决定的(如有一定的特指意义):Polyisoprene is a typical elastomer – it is amorphous, easily crossed, has a low Tg (-73°C) and a high Tm (14°C).
  ◆◆目录、标题中通常省略冠词:
  1     Introduction
  1-1     Types of Polymers and Polymerizations
  …
  1-4 Molecular Weight
  1-5 Physical State
  图、表的题目中有时可省略冠词:Fig. 2-2 Second order plot of the self-catalyzed polyesterification of adipic acid with diethylene glycol at 166 °C.……Fig. 8 Dependence of the ease of cyclization on the size of the ring.化学药品、化学物质前通常不加冠词:The polymerization is catalyzed by protonic or lewis acids although a wide variety of base catalysts such as calcium acetate and antimony trioxide can also be used.图中的横、纵坐标的名称前不加冠词。
  D. 大小写:请注意以下结构的大、小写:当提及具体第几章、节;图、表;方程式时,首个字母通常要大写。As discussed in Chapter 2, ……In Section 1.2, we ……As shown in Figure 1, ……The results are listed in Table 3.当不指明是第几章、节;图、表;方程式时,首个字母如在句中通常用小写。In the previous chapter, ……As shown in this figure, ……
  E. 缩写:以下全名和缩写在文中通常视为同等,可以互换。
  Figure     Fig.     Figures       Figs.
  Table       Tab.
  Chapter     Chap.
  Section     Sec.
  Equation     Eq.     Equations     Eqs.
  F. 一些常用词汇用法
  ◆◆research, study, investigate:research可做名词、动词,但通常做名词用,很少见到动词的用法。句中需要动词时常用study或investigate来表达。
  ◆◆detail/detailed:The properties of this compound were studied in detail.//The detailed properties of this compound were studied.//The details of the properties of this compound were studied.
  ◆◆follows/following:The results are as follows: ……//We got following results: ……
  ◆◆increase, decrease:均可做名词和动词,We can observe an increase in the reaction rate.//The reaction rate increases.
  ◆◆focus, concentrate:focus: n. , v. The focus of this paper is ……This paper focuses on ……Our study focuses on ……We focus our study on ……Our study is focused on ……concentrate: v. We concentrate our study on ……Our study is concentrated on ……
  ◆◆effect, affect:effect: n. //affect: v.
  ◆◆compose, consist:A is composed of B and C.//A consists of B and C.
  ◆◆increase, improve:increase: 主要指数值上的增加。improve: 主要指性质的增加、改善。
  G. 名词修饰:在学术文章中,很多时候会用到直接用名词做修饰,而不用’s 或 …… of …… 的形式。常见的这类词有:reaction rate;reaction rate constant;reaction temperature;reaction condition
  molecular weight distribution……
  H. 分词修饰:the reaction we studied;the temperature used;the nonlinearity observed。所有格:非人的所有格用……of……, 而不用……’s 。

如何成为一名优秀的研究生 (转)

如何成为一名优秀的研究生
Kevin Chiuo @ 2005-10-31 22:44

摘要
   这篇文章主要讲述了对于研究生来说取得成果是很重要的,并给予了一些方法,同时也为那些希望可以帮助他们的学生的指导老师提供了参考。文章的目的不是提供说明性的建议,不是为了完成一篇文章而采取固定的模式,也不是描述成为一名更好的老师所应该采取的12个步骤,本文的主要目的是提高学生和老师对师生关系的重视度,并且分析了什么样的师生关系是大家所期望的,一名研究生应该在学业过程中应该完成些什么,如果老师没有明确指导,学生应该朝何方向前进等问题。
绪论
这篇文章引发自一次我同几名女性教授关于女研究生问题的争论,并且讨论到如何鼓励更多的女学生在研究生阶段从事计算机科学这个领域。谈话的主题最终转变成这些女教授如何来支持鼓励她们的女学生。 在读研究生时,我在课程以外的时间担当志愿者,收到了各种各样的书面来信和电子邮件讨论如何成为一名优秀的指导老师,如何完成研究生学业,以及如何面对女性。他们很渴望得到这些资料,我告诉他们如果我有机会收集到这些信息将会转发给他们。
   当我向学生和老师提到这个问题时,所有的这些人都对此表现出了极大的兴趣。我意识到两点:第一,我们所谈论的问题不仅仅是单独针对女性而是所有的学生以及认真负责的指导老师都感兴趣的问题。第二,为了更好的向他人传达这些信息,我意识到自己应该完成一本书或者论文来总结我所收集到的更多有用建议和意见。
   我发动朋友和同事通过电子邮件和电子公告版的方式收集了大量的信息。从这数百万的电子邮件和大量的文章中整理出对我们相关的信息并非是易事。我希望可以为学生和老师提供有用的资源,我所提供的建议是直接面对计算机科学专业的博士生以及他们的指导老师的,但是我认为这些建议同样适用于其他领域的学生。
在我的经历中,对于研究生学校有两件事情难事,一件是过程的无组织性,另外一件是不清楚自己应该把时间花费在什么上边。我希望这篇文章可以不仅为研究生也为指导老师们提供一些建议来减少大家的痛苦。
在此我要感谢大卫查普曼,他的文章对于我的这篇文章以及研究生学校都给予了重要的参考价值。
这篇文章的目的是使大家意识到研究生和指导老师之间相互沟通交流的重要性,同时也为学生和老师在博士学习期间的迷惑提供了指导,也为其他那些希望学到更多知识的人们提供了建议和指导。

在你开始前
做一些有建议的计划是可以避免许多令人头疼的事情的。第一,为什么要上研究生?通常的理由是博士学位可以更好的找到工作,尤其是在研究和学术性机构里。并且研究生可以使你在某一领域中有机会学到更多的专业知识,研究生的学习也可以为学生提供一个激发创新和灵感的空间。想要推迟你找工作的时间则不是一个好的理由。研究生的学习需要做大量的工作并且要求创新和集中学习,你必须是发自内心想要进行研究生的学习。
这也有助于你决定自己将在哪一个领域进行研究,通过阅读该领域的一些书和前沿的杂志以及其他的参考书,可以更好的帮助你进行研究学习。通过阅读这些大量的资料你可以了解在这些领域中其他人所已经研究出的成果。一旦你进入研究生阶段你将阅读大量的资料并将会受用。这是指导老师第一步所应该做的事情:帮助本科学生找出各种相关的研究领域及其研究学校。尽量参与到研究当中:向教授及其他的人员询问在这个正在进行的项目中是否需要人手,或者是否可以开始一个独立的新研究课题。
同你所感兴趣的同学和老师保持联系,交流彼此的背景和兴趣,了解他们所从事的研究课题。如果有条件的话,通过电子邮件的方式交流是最好的方式,电子邮件即容易又比普通的信件反应快捷。一个优秀的指导老师愿意回答各种各样的问题,虽然有时他们很忙,只能给你简要的答案,或者为你简单的指点一下,你应该用直觉判断一下他们是真的很忙还是出于应付你。如果你根本不能得到任何答案,也许指导老师的意见你还未理解。考虑这些问题可以帮助你缩小选择范围,如果和你保持联系的教授对你所从事的研究也非常感兴趣的话也可以增加你参与到课题当中的机会。
最好的情况是你所在学校有至少两名同学从事同样的课题。这样如果一个人完不成工作,或者一个人太忙而不能完成工作时,你就会有后退的余地。对于大多数人来说与别的学生合作也会感到比较愉悦。有必要同研究生一起找出他们的兴趣爱好,哪位指导老师比较优秀,以及可以获得哪些帮助。因为每个学校都会有很多学生申请,经常会有高素质的学生被拒绝。你的申请应该扩大范围,不要因为被其中的某些学校拒绝而归为你自己的个人因素。
你可以通过以下几个方面来增加自己进入研究生院校的筹码。获得优异的成绩,尤其是在你自己所感兴趣的学科上;对于自己的研究领域及其相关领域有广泛的知识背景;如果需要的话应该获得一个分数较高的GRE成绩;同你的教授以及其他工作同事融洽相处,这一点是获得推荐很重要的因素;参与一个科研课题;对你自己所从事的工作应该有所计划,也许有时你会改变方向;考虑资金的来源:向NSF申请或者向你的指导老师及学校申请学费。

从事研究
   对于大多数研究生来说,研究生院校不像他们曾经所在学校,有时很难准确的了解你应该学习些什么。是的,你已经完成了论文,但是你是如何开始的呢?你应该如何安排你的时间呢?在大多数情况下,研究生院校是一个无组织的环境,研究生可以每学期只花九个小时或者更少的时间来学习,尤其是在第二年里。在第三年里,当大部分课程和考试已经结束时,这就成为一个非常困难并且有压力的时间段。找到论文题目通常是很幸运的,假定你已经找到了论文题目的,那么你可以在两年或更长的时间内完成这篇论文。接下来的部分来谈一谈在做研究过程中每日的工作,包括评价、修改论文以及研究的资金预算。

每日工作
一名优秀的研究人员应该把主要精力放在创新他们的观点并且完成它上面。然而大部分研究人员把时间主要花在阅读文献,与同事讨论,撰写修改论文上,当然,他们也会偶尔有创新的观点并且来完成它。
接下来的部分将要讨论成为一个较大研究团队中的一员的过程与重要性,这是成为一名出色研究人员的重要品质。这一部分包括如何在你的研究方向上继续向前进,你已经完成了哪些研究,保持活力,如何合理的安排时间。
定期把你自己的研究活动和想法记录下来是非常有必要的。记录下你所感兴趣的问题、问题的解决、随时迸发出的灵感以及所查找的参考书,阅读的文献后的笔记,论文的提纲和精彩的论据。周期性的重新来看看这些记录,你将会发现这些随机的想法会形成一种模式,这些想法会经常转变成为一个研究课题有时甚至成为一篇文章。当我完成了我的论文后回过头来看我的日记,惊讶的发现在我的观念中很早就已经产生了这种想法,并且和现在这些观点如此相似。
你必须阅读大量的科技论文以便于了解各个领域的发展情况,必须了解最新的科研动向。你会发现自己花大部分的时间用于阅读文献上,尤其的在开始的时间里。这种情况很正常。当你阅读了大量自己认为是应该阅读的文章后而遭受到反对时,这也是很正常的事情。记住想要把所有相关类的文章阅读完是不可能的事情,而是要有选择的阅读。当你开始阅读一个新领域的相关文献时,向指导老师和同学询问在这个领域内最著名的期刊和参考书目,以及一些经典的论文。对于AI研究者来说,一个有用的也可能是过时的观点是各种参考书目的基础。相似的观点可能存在于其他相关领域。仔细研读这些论文和近几年的期刊杂志。
在开始阅读繁琐的文章前,首先要确定这些文章是有价值的。浏览题目,然后是摘要,如果这时你对这篇文章还没有失去兴趣的话,可以简单看看绪论和结论。如果你的指导老师告诉你这是一篇很重要的文章,那么就可以跳过这几步。在开始认真研读论文前,要浏览下全文,掌握文章的重要观点。有必要的话还应该多次阅读文章。许多人发现阅读时做笔记是很有帮助的。以后不再重新阅读时,笔记可以帮助你回忆所阅读过的文章中的重要观点。如果需要回顾文章时,阅读你的笔记要比阅读整篇文章轻松并且快速的多。
当你阅读有价值的文献和期刊时,应该注意以下几点:
1.确保文章的观点是实用的而非仅仅是理论上的模型。
2.找出比喻词:这些词听起来很生动,但是可能含义不大,这其中是否隐含着更实质有趣的内容呢?
3.真正的理解文章内容。尽量理解问题产生的原因,解决问题的方式的选择,假定是否成立,没有这些方法问题是否仍然能够得到解决,这个研究的未来方向是什么,实际中已经完成的部分是什么,理论方法或者实践中经验的有效性是多大,问题存在的潜在的扩大或缩小范围是多大。
把你所阅读的文章先拿开,写出文章的段落提纲。我发现列出关键词非常有用,尤其是当这些书是你从图书馆借来的,一个简短的摘要则是文章的精华。这些参考书目会对以后你自己撰写的论文以及同其他同学分享文章起到作用。

保持活力
随着时间的推移,尤其在研究中期的时候,很难继续保持一个积极的态度和活力。许多学生感到不安全、焦虑甚至厌倦。首先,要认识到这些都是正常的感受。尽量去找一个有相同感受的倾听者——另一个学生、你的指导老师或是学校外的朋友。接下来,找出你所困惑的原因,制定正确的步骤以改变现在的形式。一定要保持活力,这可以帮助你自己安排任务,从而强迫自己每天合理利用时间来完成工作。定期与你的指导老师谈话,参加讨论会,并且可以参加课外活动,例如运动或是音乐可以都帮助你保持一个正常的心态。
查普曼列举的一些“固定不变的所应该完成的事情”将会让你为自己的停滞不前而感到内疚并且认为这是没有价值的。告诉自己应该有一个伟大的主题,在n年内应该完成的事情,自己应该每日工作4个小时或者8个甚至12个小时,所以的这些决心对于大多数人来说是毫无帮助的。要清楚的认识到你可以完成什么,对自己所完成的任务应该给予积极的反馈而不是消极去完成自己所做不到的事情。
应该制定每日计划、每周计划和每月计划,团队合作的工作则会使你工作的更好,你同其他的学生一起组成一个团队定期讨论你们的工作进展。尽量找到可以组成团队的人,如果你可以和别人一起讨论问题激发灵感并且及时的得到反馈,那么研究工作将会变得更加容易。
当课题难以操纵时,把课题划分为几个小部分来完成也是一个好的策略。处于最高的水平时,在完成博士学位论文前完成一个硕士的课题也是一个好的方法。硕士课题可以使你有机会完成一些更小范围内的研究课题,同时也可以使你同指导老师和其他同学建立良好的工作关系。
划分策略是基于日复一日的工作的。在完成一篇论文之前,应该把注意力集中在撰写每个章节,每个段落和每个提纲上面。在完成一个大系统前应该致力于完成每个小部分和每个时间段所应该完成的工作。判断这些任务你是否可以在一个小时内完成,然后制订出每日的工作进程。如果是否能完成抱有怀疑的态度,不要停滞不前,尽量在一天内去完成。记住,你所完成的任何工作都会使你离最后的工作结束目标更近。

获得主题
获得博士学位最难的事情就是撰写学位论文。这是一个寻找论文题目,进行研究,撰写论文的过程,而这个过程区别于其他任何学生阶段所做的事情。如果你有一个好的指导老师和支持群体,你将会在确定方向和目标时得到建议和帮助。如果没有,你就得独立的去完成这些工作,但是不要独自埋头苦干,尽量从外界寻找资源,这样你可以得到一些教授、其他同学、朋友、家庭以及出版社的支持。

寻找指导老师
一个合适的指导老师可以帮助你成功地完成论文。应该通过选择老师来选择你所申请的理想学校。如果条件不允许的话,尽可能早的开始观察周围的情况。当然,理想的指导老师所从事的研究是你所感兴趣的领域,所做的研究也是高质量的研究,这种老师参与团队研究并且受到尊敬。
阅读教员们的研究报告,与他们谈话,参加或者旁听你所感兴趣的老师的课程。与其他的同学或者新来的研究生谈话。询问他们与老师的关系如何,老师的学生多久可以毕业以及他们的研究成果如何。他们的关系是哪一种,经常交流还是合作工作,还是鼓励性的独立研究?或者是指出题目,帮助学生独立研究课题,还是其他的一些方式?
关于寻找未来指导老师还有其他的注意事项:
1.他们的博士生完成学业的平均时间是多久,他们的学生的退学率有多大。
2.他们在学校从教的时间有多长。如果你的老师在这个学校从教不久,那么你成为这个研究团队中的一员有优势也有劣势。积极的一面是,你可以有更多的自由选择你所研究的主题,并且可以影响团队的研究方向。消极的一面是,团队中没有年长一点的研究生,你可能会被孤立,你的指导老师可能会没有足够多的经验。
一位好的指导老师好比一项好的技术资源。导师应该提供或者帮助你找到你所需要的资源,例如资金、设备以及心理上的支持,他们应该向领域内的重要人物介绍你和你的工作,鼓励你继续完成自己所感兴趣的事情。好的老师会对你的论文和职业方向有好的建议和指导,并且在你完成学业后帮助你找到工作。他们应该帮助你设计并且完成各种长期和短期的目标。
一旦你确定了一个或更多的未来指导老师就要去认识他们。自我介绍并且让对方了解自己所感兴趣的研究领域。参加他们的研究团队的讨论会议。如果你对你自己想从事哪方面的研究有一个很好的规划,那么给老师一份研究计划,并且要求他们给予评论。问老师是否有TA或者RA职位,或者他们是否有正在进行的课题,如果有的话尽量申请参与课题。阅读他们的论文以及他们的学生的成果。问一些相关的问题并且互相发表意见,在阅读他们的文章时应该多加思考而不是仅仅做一些校正性的工作。
每个学生所需要和指导老师建立的关系都是不同的。有些学生喜欢被给予更多的方向性指导,有些喜欢经常和老师保持联系,而有些学生则很独立。有些学生需要经常和老师保持联系而又会在独立思考的情况下向老师咨询一些问题。其他的问题则是多样化的,包括哪种反馈是首选的,是独立工作还是在团队中工作,是在一个已经成立的课题组中工作还是开始一项独立的新课题研究,是同你的指导老师从事同一项课题的研究还是做别的方面的研究。
你也许会发现论文指导老师所给你的意见并不都是你所需要的。同时有多个指导老师也是很普遍并且对你有所帮助的,这些指导老师是指学院里或者其他地方的其他老师、年长一些的同学以及其他同事。如果你的指导老师难以接近或者对你的研究方向没有兴趣,只是给予你少量消极的反馈意见,或者这些老师根本不具备专业背景或是骚扰你,这时你可以仔细考虑是否应该更换老师。
最重要的事情是了解自己到底需要什么。

论文的选题
做一个硕士项目通常是一个好主意(而且某些学校要求这么做)。 也许找到一个合适的层层递进的主题并不容易,但是不能找到一个非常理想的主题并不太重要,因为大概一年以后你有重新选择的机会。如果你对你的博士论文有很好的想法,选个能向这个方向深入的硕士项目是很明智的:你会为你的博士学习开个很好的头,或者通过做这个项目发现上面的想法其实你并不感兴趣(这样由于只在这个方向做了一点而省了很多工夫和痛苦)。
从硕士项目(有时从论文选题)中获得一个好的想法将是未来研究工作的一个组成部分,应当努力发展和实施以延伸现有的体系或技术。
一般来说,好的博士论文选题既是自己感兴趣的,也是导师和研究团体所感兴趣的。在一些研究生院,在这种均衡至少在一定程度上依赖于你和导师的关系。有些教授早已详细制定了长期的研究计划,因此他们希望学生能够直接完成该项目的研究工作。另一些教授没有长期的安排,但要求他的学生做正在进行中的项目。还有些教授,照顾到每个学生的兴趣,并能为不同兴趣的学生提出广泛的指导想法。要小心那些让你任选研究领域研究的教授,你很可能不能从教授那里得到技术支持,并且如果接下来的研究生提出了好的想法,这些教授会对你失去兴趣。
如果你选择了一个自己并不是真正感兴趣的题目,而仅仅是因为这个选题是你导师当前的研究领域,这将使你很难长时间保持对研究的专注与热情,如果你的导师在你研究结束之前转向新的领域,你很可能处在没人管的状态。同样的情况出现在你的选题是一个市场热门的研究领域,但是你对它并不是真正的感兴趣。你将会花费更多的时间去完成这个选题,同时需要花费更多的时间去说服别人,你的研究是有意义的。更何况,很多时候市场热点切换的很快,在你的研究完成之前,它已经不再是热门的领域了。
为了能够做出原创的研究,你必须时刻关注你的研究领域内最新的研究成果。很多研究生需要花费一年的时间阅读和学习当前的研究论文,以确定哪些是目前非常重要的,有待解决的问题。然而,因为新的论文、专著总在出版,你是不可能读遍相关领域内的所有文章。
要关注相关领域内的研究成果。但当你发现新的研究成果与你正在研究的很接近时,请不要慌张。在研究生中一个很正常的现象就是他们看了相关的一系列论文后,认为论文是有问题的。如果这种情况发生在你身上,你应该重复看论文并找到别人论文到底取得了哪些成果。把论文给你的导师或者在熟悉该领域的人看。在学术会议上或者通过的电子邮件的方式,将自己介绍给原作者,并解释你在该领域所做的一系列工作。开始对话的方式最好是你发现两篇的论文有所不同。这样也留给你以一定的空间。可能达成的一种结果是合作。优秀的学者非常欢迎和与他相同领域的人交流与协作。
想尽快地完成论文,最好选择窄的,精心设计的题目。这样做一个不好的结果是你对它并不感兴趣,或者研究团体对此不感兴趣。如果你是一个风险接受者,你可以选择一个拓展新领域的题目。这里的风险在于很难周全的定义问题,也很难估量你研究的成果到底有多大意义。当你有了这样的选题,如果你还有个导师能告诉你要点,还能帮你找到一个合理而有力的途径解决这个问题,你将会受益良多。
一种极端的情况是,你的选题非常的独树一帜,以至于没有相关的论文。这时你需要花费很大的精力说服别人你的研究是有意义的。事实上创新性的研究工作是令人激动的,同时你的成果可以得到研究团体的认可,然而如果没有成果你也很可能一事无成。如果你选择了这样一个研究题目,一定要确认人们对此事确实是有兴趣的,否则你很难发表你的研究成果,你也很难找到合适的工作。另外,独创性的选题亦很难找到和你研究内容相同的同伴,因此你也很难得到别人的建议和反馈。
在任何情况下,好的选题关注重要的问题,你应该努力去解决实实在在的问题,而不是那些意义不大的问题(更甚者,不是问题的问题)。你应该做出扎实的理论工作,或者良好的实证结果,或者两者兼备。同时选题应该与现有的研究结合。好的选题同样是易于处理的。选择一个合适大小的问题往往是非常困难的事情。一个最好的选择问题大小的手段是阅读别人的论文。Chapman提出的压缩组织也不失为一种好的办法。
要记住,论文只是几年的工作,如果一切正常的话,你的研究生涯将保持30-40年。因此,没有必要害怕留下一部分工作以后完成,你也无需和那些资深的学者比较。(另一方面,如果你过多地考虑了未来的工作,你的论文看起来将不会那么精彩)。研究生常常犯的错误是他们往往选择过于有挑战性的题目(理论上讲,老师应该帮助学生选定一个合适的题目)不要过高的评价别人的成果。只需要好好学(别的你的老师将会帮助完成)
一些学校会要求你写一篇论文的写作计划(即开题报告)。即使学校没有要求,这也是一个非常好的开始。它促使你定义问题,勾画出可能的解决方案,确定评价指标。从开题报告中,同时可以得到导师和其他同事的有用的反馈意见。一篇高质量的开题报告往往需要花费几个月的时间,当然这也依赖于平时的基础工作以及在选题时的准备工作。
开题报告应该为论文写作提供一个基础。首先,你必须描述清楚这个问题,而且令人信服的说明解决这个问题的必要性。你还需要说明解决这个问题的方法。同时你必须讨论相关的研究工作:这个问题以前是否提出?现有研究工作的不足之处在哪,以及你的研究与其他人的研究有何不同,改进的地方等等。
尽可能细致的介绍你的研究思路,制定出详细的研究计划。开题报告应当包括论文的概述。事实上,除非最后的选题与计划的选题有很大的不同(很多情况时如此),你可以在论文中重复使用开题报告的内容。
你有可能需要参加答辩,回答关于开题报告的问题。这时,你要尽可能的使答辩委员会委员的事先了解你的工作。比如事先复印开题报告给那些委员,并同他们讨论。在答辩中,当你不知道如何回答时不必紧张。你可以简单的表示:“我不太确定”,然后尽可能地认真分析这些问题,并提出当前可能的答案。答辩委员会的委员非常在乎你分析问题的技巧,而非想得到一个预先准备的答案。对老师及其他同学做的介绍要实用,你要记住:你对这个选题的了解要比委员会更深入,你是在教他们。

论文的写作
研究生经常会认为论文的写作有两个截然不同的阶段:做研究,写论文。对于有些同学可能确实如此,但更多时候,这两个阶段是交迭的和相互影响的。有时在动笔之前,很难想出检验和证明的方法;同时检验的结果常常需要你回过头,重新修改论文的部分内容;发展和检验你的想法是永无止境的(总会有需要不断深入的地方),所以大多数研究生在论文提交前的一两天才完成研究工作。
“分块击破”的方法对于论文的写作以及研究工作都非常有效。大多数研究的问题是他们唯一的目标就是“完成论文”。无论写论文还是做研究,将大的问题分解为可以处理的小部分很必要,如果任务一周就能完成,一天完成,甚至半小时就能完成,这个目标将更为现实。尽可能的把任务按照所需时间和难度上分成不多的若干并行的部分。这样的话,你精力比较旺盛和热情高的时候可以啃一些难题;动力不足的时候解决简单的,这样你至少可以完成一些小任务。
“分块击破”同时可以帮助你在混乱无序中开始写作,逐步精炼中最后的论文。不要开始不动笔,期望将整篇论文从头写到尾一气呵成。首先,应答记下论文中准备涉及的内容,接下来组织成提纲(提纲在研究和论文写作的过程中可以随时修改)。再下来,写草稿部分,先写你最有把握的部分。论文的初稿不要奢望写得很完美:比如当有些段落没有写不出来时,你就标注“something”继续写下面的。你可以随时返回来完成比较困难的章节的写作。写作中尤其重要的一点就是循序渐进。
在写作论文(或者任何技术性的文章)时,你要意识到你的听众几乎都没有你熟悉这个领域。你需要清晰地解释写作的动机,期望的目标以及使用的方法。你可以在不觉得无聊的情况下适当的重复。把你的想法分出层次,同时穿插一些例子做具体说明问题。
有一个“笔友”是一个不错的想法。如果他们同时也在写论文,那就更好了。但最关键的是笔友愿意对你写得论文初稿提出反馈意见,可以经常和你见面,引导你的进步并给你精神上的支持,足够熟悉你的研究领域,可以评价你的论文。

收到反馈
学会甚至积极探索如何对待批评意见是科研成功的一个基本要素。学会倾听建设性的批评,忽略带有破坏性的和无意义的指责(在发掘出埋藏在其中的任何一颗智慧的珍珠之后),取其精华,去其糟粕。
为了得到反馈,你必须阐述你的观点。把你现在正在做的工作写下来给大家看,即使你不打算写一份会议或者期刊的论文。即使对即将发表的论文,仔细清楚的写下来,也会大大增加你得到有用评论以及让人们读你作品的机会。
只要你有机会,就要在你学校的系列研究会,会议上,以及其他的学校和研究室等作阐述。你的指导老师应该帮你去找合适的论坛去阐述你的工作和思想。很多领域都有对阐述工作紧张很理想的非正式的讨论场所。
出席会议并谈论你的研究工作。当你遇到一个生人问你正在做什么工作时,要抓住这个机会。不要只是说“我正在做关于某种算法的foobar应用的论文”,而应该在他们愿意听的情况下尽可能多的告诉他们。你应该在很短的时间内作好30秒,2分钟,5分钟,和10分钟的论文总结,但不用一个词一个词的记下来,没有人喜欢听录音似的讲述。
和其他人谈话可以帮你认识到和你的研究完全不同并且具有创新的方面,你的工作如何才能适应你的领域和发展方向,哪些方面是你的工作难以做到的(因此你需要多考虑调整一下)。
同样,给其他同学或者同事反馈在很多方面来说是很有用的。首先,会帮助你提升你评论的技巧,同时也对你理解别人的工作和评估你自己的研究内容都有好处。其次,帮你建立一个若干年之后可能是你的同事的交际网络。最后,如果你给了有用的回馈,很多人会乐意像你对待别人一样来帮助你。
对你或者其他你要评论稿子的作者来说,以摘要递降的顺序组织对一篇文章的评论是很有帮助的:高层的内容注解,中层的格式和阐述注解,底层的语法文法注释。试着做些建设性评论如“也许你在引入Y之前定义一下X读起来会好一些”,而不是破坏性的“这是废话”。
一篇文章,你应该至少读两遍。第一遍是得到一个基本内容,第二遍做些注解。高层的注解描述了你对这片文章的整体印象,在组织结构,表达方式,选择途径,扩展潜能和相关的参考文献方面的建议是很有意义的,也是比较难给出的。底层的注释一般是对那些即将发表的而不是对那些没有发表的建议或者对初步研究的描述。

资金支持
很多研究生(至少自然科学领域)都有一个支付他们的学费资金来源和生活费津贴。虽然读研究生不会有多富有,至少不会饿死。资金源头包括奖学金(NSF,大学,基金会,政府部门,产业),老板的资助,助研津贴(系里的老师的科研经费)和助教津贴。
早动手寻找资金。很多学校在第一年以助研或助教的岗位形式统一安排,之后,你就要靠自己了。申请的截止时间是不缺定的,如果你错过了一个,你很可能要等到第二年。你申请了之后需要6个月左右去复审,实际收到钱可能要需要更多的时间。
咨询一下系里的老师,特别是你的导师,就是能够帮你找到奖学金或者可以在他或她的经费里面给你支持的人,系主任,和其他同学。到你学校的奖学金办公室或者类似的机构,查阅一下清单,如"The annual Register of Grant Support","The Grant Register","The chronicle of Higher Education",和"Foundation Grants to Individuals"。看一下NSF的讲学金(通常由很多项目)。利用你的优势如女士,或者少数民族之一(这可能是唯一一次其作为优势的机会)。很多大学都有奖学金项目被分配到各个系或者整个校园范围内。
如果你现在还没有开始做科研,从一个系里老师那得到一个助研的职位是进入一个科研项目的不错的方式。
从事一个现有的研究项目中的维护或者开发软硬件,写文档或者做实验都会让你一种做科研的感觉,没准你会发现一个论文题目。问一下周围的人看看是否可以利用,去和你感兴趣的工作的负责教授谈一下。
科研经费支持或者奖学金,你很可能需要写建议,关于论题潜力的内容,思考的越多,就越有好处。你需要调整你的建议去满足你所申请的特殊的基金会政策或者计划,但是要保留你的兴趣所在。
写一个普通的稿子,因为审查你的申请的人可能并不一定都是这一个领域的。把重点放在你的目标和你提的这个课题重要性。尽可能多的介绍你是要如何解决这个问题的,确定你提出的解决方案可以完成你预订的目标。按照这个规则对格式的要求,调整页面布局和长度,否则,你的申请可能不会被审核。

对导师的建议
要做一个好的导师,你必须把你的研究生当成单独的个体,而不是仅仅认为是匿名的助研或者,所有和共同发表作品的人。和你的所有研究生一起工作而不是那些你喜欢的,或者和你有共同兴趣者。试着亲自并且专业的去了解你的学生。帮助他们评定他们的优势和缺点,发扬优势,克服缺点。对他们的工作和表现给与最正直的评价:不是仅仅假定他们知道做的如何和你怎样评价他们。
从发现你的学生中有困难,或者是没有意识到重要性的研究生经历某些方面的角度,来读这篇文章和其他类似的。试着去观察他们的不同经验阅历,因为每个学生都有不同的背景和不同的才智和理想。
导师的角色包括:
1.领导学生的科研:帮助他们选择一个课题,写研究计划,完成研究,严格评估,完成论文。
2.帮他们融入到更广阔的研究团体:把他们介绍给同事,和他们进行研究课题的合作,参加会议,鼓励他们发表文章,推荐他们获得奖励。
3.寻找资金支持:提供助研或者帮他们申请讲学金和暑期实习。
4.毕业后找份工作:帮他们寻找和申请博士后,大学教学职位,工业企业职位,大力推荐他们以支持他们的申请,帮助他们联系。
尽管指导学生的科研一般被认为是一个导师的中心工作,但另一个决色对他们的长远的成功也是艰巨的。关于人际关系方面的部分包括了对学生关于人际关系方面的建议。在这个工程中你可以在资金和鼓励他们参加会议和论文发表方面帮助他们,并且可以介绍他们给同事,与同事讨论他们的研究工作。

与学生之间的交流
和学生之间建立一种正确的交流方式尤其是对一个新的指导老师来说是一项艰苦的工作。不同的学生会对不同的方式作出较好的反应,而且,不同的指导老师也有不同的风格。在每一个指导老师和学生之间一些利弊必须权衡,如下:
1. 指导的量:对于题目和研究课题是自我管理还是手把手的教。
2. 个人交情和心理上的辅助:他们是否需要关于职业,家庭和其他方面的建议?你是否愿意并且能够提供这些建议,或者找到能为他们提供这些建议的人?
3. 提出批评的数量和类型:是一般性方向的,还是针对提高的特别建议。
4. 交流的频繁程度:是每天,还是一学期一次。
以上这些有助于建立规则的会面,而且讨论想法(你和你的学生之间的)关于会面时能够而且应该完成的想法。应该鼓励他们发展和其它的院系的师生的良好关系,从而获得不同的观点和反馈,你不应该只是付出。
如何建立交流时的良好气氛:
1. 在用餐或咖啡时见面,促使交流更加轻松活跃。
2. 努力保持开朗,互信的关系。像尊重同事一样尊重你的学生。
3. 告诉学生是否他们要求过多或者过少的时间,或指导。
指导老师应该既了解长期需要也了解短期需要。在未来的几年里学生的目标将变成什么?帮助你的学生识别一种可以使你们作为一个整体能共同满足的目标。给学生提供关于成功的资格考试,论文和学术演讲方面的建议。帮助学生为寻找工作做准备。
在短期看来,一个优秀的指导老师会和学生一起去分清主次,在进行研究,阅读习作,助教助研,发表文章和课程之间寻求平衡。尽管指导老师不可能在研究生学校的所有管理方面给学生提出建议,但是他们至少应该了解应该把学生推荐给那些适当的人,当学生遇到某种程度的助理,资金问题等等。
当你和你的学生见面时,应集中精神。要试图帮助他们明确他们的兴趣,爱好和目标,而不是如何使他们满足你所认为的兴趣,爱好和目标。要了解他们目前所进行的工作和你们上次所讨论的内容。在每次会面时都应作记录,如果有需要应经常回顾。
给学生提明确的有意义的反馈,而不只是不明朗的“好,当然”或者破坏性的“你究竟为何要那样做?”这种建议。牢记一点,你的学生仍然在学习过程中。如果你告知学生们,他们感兴趣的一个问题已经被某个教授解决了,确信你随后给他们提供了他们能够的得到的关于问题的参考,和关于是否这个问题仍然是一个值得继续研究的领域的讨论,还是是否存在在下次会面时通过某教授的工作所提出的新的问题,。
当浏览一个学生的论文或提议时,要在纸上写下你的评语:口头的评论是无用的。应迅速的进行反馈,否则帮助有限。关于如何提出有用的建议,请看反馈这一部分。不要只是等到学生递交给你东西你才去读:坚持写书面形式的建议草稿,关于论文的等等。帮助他们把粗略描述的思想发展成为可以发表的论文。给他们提明确的具体的关于下一步该干什么的建议,尤其是当他们在踌躇时或没有进展时。
如果指导老师将学生的目标设定得过高或者过低,或者利用学生来满足指导老师自己的需要而不是学生的需要时,指导老师和学生之间的良好关系会被破坏。在我个人看来,指导老师和某个学生建立过于亲密的关系无论如何都是不合时宜的。如果发生了这种情况,指导老师就不应在继续指导学生(无论关系继续存在与否)。
鼓励你的学生选择一个你们都感兴趣的主题,而且你也应对此有足够了解(或者是非常愿意对此深入学习)。确信你的学生有充足的背景知识可以理解这个问题,而且他们所能提出的解决问题的方法是恰当的符合实际的。给他们列出实用的参考资料,并帮助他们找到这些资料(这对一个研究生可能是既神秘又困难的过程)。确信他们了解从事相似研究的其它研究者或者实验室,而且如果可能,组织他们去参观这些实验室,在研讨会或讨论会上与这些研究者见面。
女性的指导教师经常觉得有义务指导院系内的每一位女学生,出席每一次委员会会议,加入到每一个讨论中,无论她们愿意与否。尽管你不可能解决世上的所有问题,即使你没有足够的时间参与到所有的问题,但你至少应使其它的女性明白你的确很关心这些问题,并且你觉得这些问题很重要。

成为研究团队中的一员
一个研究生应该做的最重要的事情之一就是,成为一个确定的研究团队中的一员。你的指导教师可以在这方面帮助你通过以下的方式:资助你参加研讨会,鼓励你尽早的发表研究结果,合作发表,向他的同事推荐你,促进你的工作。
相应的,指导老师也可以使自己更加突出,通过参与讨论会和工作组,发表相关工作方面的文章,保持和同事之间的联系。

出席会议
无论你发表文章与否参加讨论会或工作组都是很有意义的。这样做的一些理由如下:
1. 你有机会见到其它的人,并和他们讨论各自的想法。
2. 你将更好的了解目前研究所出的是怎样的状态,而且将会了解更多有关于如何写会议文件和发表演讲(有时通过举反例)。
3. 你很有可能认识到你的想法很有意义,比你所想得更有说服力。经常地反映是“我还可以写一份比这更好的文章”。
如果你进行了演讲你将有更加明显的收获,而且你将有机会给其它的研究人员留下印象。如何准备一个给人留下深刻印象演讲,需要注意的细节问题如下:
1. 应进行练习性的讲演,尤其是如果你想在讲台上达到令人吃惊的效果。一定要邀请到那些能给你提出建设性并且有用的反馈的人。
2. 确定你的演讲在时间安排上有条不紊。没有比演讲者匆忙的将最后的10张幻灯片一闪而过或者从讲演的中间突然跳到结论更糟糕的事情了。一条好的规则是平均为每一张幻灯片都留有2—3分钟。
3. 最好是略有抽象而不是拘泥于技术上的细节——但要确定你给出了足够多的细节可以产生一个令人信服的情况。你的文章中应包含你没有提及的细节,以便于人们可以通过阅读你的文章来得到更进一步的理解。应了解你的听众:你会不得不给一个普通听众更多的背景知识,而为那些对你所讨论的领域的研究非常了解的听众提供更多的技术细节。
4. 使用例子和图片来清楚地展示你的想法。
5. 通过观察进行学习:努力模仿你所喜欢的谈话风格,并且不去理会其他演讲者所说得令你烦恼的东西。
6. 无论何时,只要有机会你就可以非正式的讨论你的想法,这样你的谈话将变得更加自然,并且你将很有希望得到反馈和有机会思考在谈话中可能被问及的问题。
7. 确信你的演讲幻灯片尽可能的简单而容易被人阅读。决不要放出一张有很少文字说明的幻灯片却说“我了解你们无法理解这个,但是”。
8. 试着去放松。不要一字不漏地按照手稿或幻灯片讲话,而且也不要说得过快。要有自信:你比任何人都要了解你所进行的工作(无论是缺点还是其他)。

发表论文
发表你的想法很重要,有以下几点原因:这会给你提供来自读过你文章的人的反馈意见;这会使你成为研究团队中的一个成员(有助于以后寻找工作);这会促使你整理你的想法,并使你的想法符合你所从事的研究领域的目前状况。
一篇好的论文应具备以下两个特点:意义深刻的内容——经过充分发展和严格检验的创新,重要的思想——优秀的写作风格。论文的内容到达何种深度才能算作意义深刻取决于你在哪里发表这篇文章!取得初步进展的想法和工作适宜在讨论会和研讨会上提出;充分发展和严格检验的更适宜发表在刊物上。可以决定论文发表在那里的一种方法是阅读可能发表你文章的出版物上的论文(去年的会议学报,当期的刊物)。另一个办法是给你的指导老师或其他同事看一份论文的草案或大纲并向他们寻求建议。
如果你有一个很好的想法,但却表述很糟糕,你的论文很可能不会被接受。确信你清楚的知道论文的要点是什么,并将它给予明确的阐述,反复的强调。对待重要的技术思想同样可以采取这种方法。不要让读者努力发现什么是重要的,而要明白地告诉他们。否则,你会误导你的读者,如果他们厌烦了就更本不会读完你的论文。展示你所提出的问题,为什么它显得重要,你是如何解决这个问题的,你得到了什么结果,其它的研究者是如何提出相同的或相似的问题的,和为什么你的方法是不同的或者是更好的方法。
要为那些你期望会读你文章的人而写,就想你在准备一个演讲。为一般的读者提供更多的背景知识,为那些专业读者提供较少的背景知识和较多的技术细节。如果可能应使用一个连续的例子,尤其是你的文章中充满了方程和数学运算式时。
不要试图将你论题中的所有的想法都放进一篇讨论会论文中。要将它分成部分,或者写一到两篇更长的期刊文章。
如同精炼你的想法一样,你可以以新的形式重新发表文章,但要确信你增加了新的内容,而不只是重复同一个想法。一些文章开始只是简短的讨论会文章,后发展成为讨论会文章,并且最终——随着正式数据和经验结果的不断被增加——变成了期刊文章。经常在多个研讨会上发表相同的或十分相似的文章是允许的,但是正式会议和期刊的文章一般必须是原创的没有被发表过的成果。

人际关系
在研究生时代你需要学习的最重要的技能之一就是“人际关系”。参加研究团体需要出席会议、会见有成就的学者,并且让自己为人所知。人际关系是一种学术技能,所以你不应该希望在短期内就能精通它。但如果你想成为研究团体中的成功者,它肯定是一种你能够并且应该学会的本事。
仅仅参加会议不发言是不行的。尤其当你不是一个外向的家伙,你必须自发努力去会见其他学者,和他们搭上关系。发表论文是个不错的办法,因为人们会讨论论文从而逐渐熟悉你。如果你对谁的论文感兴趣,就向他作自我介绍,然后问一个相关的问题或者向他描述你相关的研究,这也是个好的方式。
一有机会就应该谈谈你的研究结果(但同时也要花一些时间来聆听,这样你会学到更多,人们也会觉得你的谈话是双向的,而不是单方面的)。用心准备好关于你的工作范围、水平的概略,以便能聪明清楚地应付那些不可避免的“最近工作如何?”。如果有人对你的工作表现出兴趣,那就穷追不舍。给他们发E-mail讨论新的想法或者问些问题,把你论文的草稿发给他们,问他们要草稿然后回复你的评论。(如果你这么做,他们肯定会记住你!)带你的业务名片和E-mail地址到研讨会上能帮新认识的人加深对你的记忆。
通过发E-mail来巩固你已经建立的关系,并和你参加过的每个研讨会或者学术会议重新建立联系。如果你致力于它,利用原有的熟人去认识新人。你会发现你的人际圈子很快越来越大。

埋头工作而不娱乐
能在工作、娱乐以及其他事务中达到平衡并不容易。不同的人会给你不同的建议。一些人让你把清醒状态80%-90%的时间用在论文上,另一些人(包括我在内)认为这不切实际,而且对健康不利。为了你的身心健康,你应该有其他的兴趣爱好。
如果你已经成家,你将不得不更小心地平衡这一切。研究所可不值得你拿自己和家人的关系去冒险。要确保你能给对你来说重要的人留出时间和精力。
平衡你生活的关键之一是制定一个前后一致的时间表。你可以决定你只在白天工作,把晚上的时间留给你的业余爱好。或者你可以在下午社交和锻炼,晚上工作。我在读研究生的时候很早就决定周末是属于我,而不是我的论文的。我觉得这个决定使我保持清醒的头脑。
很多研究生在第二年末或者第三年初,完成课程同时致力于论文题目时会感到情绪低落。有时这个过程还会持续很长一段时间。试着找出有益的、有趣的并能把你从论文中解脱出来的活动。参加唱诗班,学习一门外语,研究古希腊的历史、园艺、针织等等都可以。当你安排好日常活动(彩排、网球课),你就会发现要避免漫无目的的度日并不困难。
在完成你的论文的冲刺阶段,你用在社交活动上的时间几乎肯定会比平时更少。不管是否出于本意,你的朋友会让你觉得内疚。提前告诉他们你会拒绝许多邀请,这和个人无关,只是你要花一段时间写你的论文。等你全部搞定的时候,你就会像只小鸟那样自由了。

女生的问题
尽管这篇文章是从讨论关于女研究生的问题开始的,但它引出了一些东西,我觉得不仅仅适用于女生。当然这并不是说女生不会遇到特殊的问题。
许多时候,不同性别的研究生会遇到同样的困扰,但反应不同。对女生来说,有时(不是经常)会出现一些额外的因素:孤立、自卑、歧视、家庭责任带来的特殊压力、得不到广泛的支持以及缺乏相应的经验。摊上个不负责任的导师对女生来说更是个问题。我希望这篇文章在某种程度上能帮助女研究生和她们的导师营造一个积极向上、互相支持的环境。
   我改变文章的主题部分原因是由于最近已经有许多关于女性科学家以及女性研究生的文章了,这些文章仅适合于少数学生,如果有兴趣可以发电子邮件systers-request@pa.dec.com获取信息。

结论
另外文章中我所直接引用的别人的文章,以及我所发现有所帮助的文章都列举在了参考目录中。
伯克利大学“研究生”杂志是由伯克利大学研究生院成立的一个关于出版时事通讯方面文章的出版社,他们出版的大多数文章是研究生所感兴趣的。我发现这家出版社对于研究生院校和相关性的文章具有大量的信息。在参考目录部分列出了一些较具特色的文章。
一些文章也对研究生院校给出了一般的建议,并且对如何进行研究也给予了建议。
许多关于提供建议的文章被成功的运用到现实生活中。
研究生院校也有很多困难,有很多学生是在没有学术基础或者不支持学生的导师的指导下被迫进行学习的,有些院校也缺乏相关的知识,成为一种官僚机构,或者还有其他的障碍。我尽量给研究生和指导老师们提供一些建议,帮助他们跨起这些障碍。
 
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这里的东西很特别。
虽然不懂,
有些懂点,
一些是懂。
呵呵~
就留言让你知道咯。
Wink
 
10 月 7 日
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